RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 PLA2G4DQ86XP0 818 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ADGRG5Q8IZF4 528 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CFAP52Q8N1V2 620 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 C4orf32Q8N8J7 132 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 SLC30A5Q8TAD4 765 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CRYGNQ8WXF5 182 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 MXRA8Q9BRK3 442 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 LRFN3Q9BTN0 628 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 PANK2Q9BZ23 570 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 KLK15Q9H2R5 256 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 PDGFCQ9NRA1 345 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 FLRT1Q9NZU1 646 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 SLC17A6Q9P2U8 582 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 GJD2Q9UKL4 321 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 MGAMO43451 1857 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 VWA3AA6NCI4 1184 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 PP2D1A8MPX8 630 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 SPTLC2O15270 562 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 MSH4O15457 936 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CHMP2AO43633 222 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 NEMFO60524 1076 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 SUN1O94901 812 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CYP3A4P08684 503 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 MALP21145 153 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CCND2P30279 289 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 TECP42680 631 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 IL12RB1P42701 662 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ME1P48163 572 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 TRAPPC10P48553 1259 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 MAPK10P53779 464 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 SP2Q02086 613 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 SP4Q02446 784 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 DYRK1AQ13627 763 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 KIF22Q14807 665 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 SLC39A14Q15043 492 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 LRRC41Q15345 812 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 STXBP2Q15833 593 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CALCRLQ16602 461 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CEP55Q53EZ4 464 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 KAZNQ674X7 775 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 VWA1Q6PCB0 445 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 USP49Q70CQ1 688 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ARMCX2Q7L311 632 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ZBTB46Q86UZ6 589 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00301Q8NCQ3 95 aa5.24□□□□□ -1.57
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PTPRC-211ENST00000484135 USP6NLQ92738 828 aa5.24□□□□□ -1.57
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PTPRC-211ENST00000484135 PLIN2Q99541 437 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 SLC13A1Q9BZW2 595 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 BRD9Q9H8M2 597 aa5.24□□□□□ -1.57
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PTPRC-211ENST00000484135 SLAMF7Q9NQ25 335 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 SEMA4GQ9NTN9 838 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ASB6Q9NWX5 421 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ZIM2Q9NZV7 527 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 RCOR1Q9UKL0 485 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CFAP45Q9UL16 551 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHA7Q9UN72 937 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 DOCK5Q9H7D0 1870 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1B0GVL5 298 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
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PTPRC-211ENST00000484135 CCDC151A5D8V7 595 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ASB14A6NK59 587 aa5.23□□□□□ -1.57
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PTPRC-211ENST00000484135 F2RL2O00254 374 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 MPPED1O15442 326 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 AKAP10O43572 662 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 ARIH2O95376 493 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 SCGB1D2O95969 90 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CHRM2P08172 466 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 OR52Z1P0C646 297 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 PPP3CBP16298 524 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 GATA3P23771 443 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CYP3A7P24462 503 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-211ENST00000484135 CIITAP33076 1130 aa5.23□□□□□ -1.57
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