RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480054.1

RABGAP1-210, Transcript of RAB GTPase activating protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGAP1, Length 423 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGAP1-210ENST00000480054 SLC38A8A6NNN8 435 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 NKX2-8O15522 239 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 RNMTO43148 476 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 NR2F6P10588 404 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 CTGFP29279 349 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 AVPR1BP47901 424 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 PDE1AP54750 535 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 E2F1Q01094 437 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 UBE3AQ05086 875 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 CHRNDQ07001 517 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 FAM187BQ17R55 369 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 P3H1Q32P28 736 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 C1orf141Q5JVX7 400 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 ACSM6Q6P461 480 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 SFTPA1Q8IWL2 248 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 LCORLQ8N3X6 602 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 SLC2A12Q8TD20 617 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 GLMPQ8WWB7 406 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 SLC9A6Q92581 669 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 TWNKQ96RR1 684 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 UNC45AQ9H3U1 944 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 CCDC134Q9H6E4 229 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 DUSP22Q9NRW4 184 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 DLL3Q9NYJ7 618 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 PNMA2Q9UL42 364 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 MAP3K5Q99683 1374 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 SBF2Q86WG5 1849 aa6.25□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 SAC3D1A6NKF1 404 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 CCER2I3L3R5 266 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 J3KRW8 73 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 M0QZQ0 153 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 URI1O94763 535 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 ESRRBO95718 433 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 POLBP06746 335 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 CYP3A4P08684 503 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 JUPP14923 745 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 MAKP20794 623 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 MATN1P21941 496 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 TMPOP42166 694 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 GRIA3P42263 894 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 DGCR2P98153 550 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 RETSATQ6NUM9 610 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 ABHD11Q8NFV4 315 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 TFAP2BQ92481 460 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 NPIPB3Q92617 1050 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 GOLGA1Q92805 767 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 MCRS1Q96EZ8 462 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 COG8Q96MW5 612 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 NPAS1Q99742 590 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 MECRQ9BV79 373 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 FSD1LQ9BXM9 530 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 SNX15Q9NRS6 342 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 BAG5Q9UL15 447 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 ASAP1Q9ULH1 1129 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 KAT6BQ8WYB5 2073 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 NHSQ6T4R5 1651 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 MRC1P22897 1456 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 AP4M1O00189 453 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 SEPT4O43236 478 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 XBP1P17861 261 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 YY1P25490 414 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 MPLP40238 635 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 CCR5P51681 352 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 TLE3Q04726 772 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 DEUP1Q05D60 604 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 MPP3Q13368 585 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 TRPC3Q13507 836 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 BFSP2Q13515 415 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 CBFBQ13951 182 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 ANKRD1Q15327 319 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 CTXN3Q4LDR2 81 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 MCM10Q7L590 875 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 CHODLQ9H9P2 273 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 TMOD3Q9NYL9 352 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGAP1-210ENST00000480054 KCND3Q9UK17 655 aa6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms