RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475319.1

ECHDC1-215, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene ECHDC1, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-215ENST00000475319 PRUNE1Q86TP1 453 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 CCDC25Q86WR0 208 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 PM20D2Q8IYS1 436 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 RFWD2Q8NHY2 731 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 COPS5Q92905 334 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 VPS33AQ96AX1 596 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 CNDP1Q96KN2 507 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 HS6ST2Q96MM7 605 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 C17orf80Q9BSJ5 609 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 SARGQ9BW04 601 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 ACAT2Q9BWD1 397 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 TMEM168Q9H0V1 697 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 HPS4Q9NQG7 708 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 TBC1D22BQ9NU19 505 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 PRR13Q9NZ81 148 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 SENP1Q9P0U3 644 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 DNAJB4Q9UDY4 337 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 TAGLN3Q9UI15 199 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 TEKT2Q9UIF3 430 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 GMEB2Q9UKD1 530 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 VPS4AQ9UN37 437 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF175Q9Y473 711 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 SAR1BQ9Y6B6 198 aa6.15□□□□□ -1.42
ECHDC1-215ENST00000475319 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 A8MUI8 341 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 STMND1H3BQB6 276 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 TRIM77I1YAP6 450 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 PRRG2O14669 202 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 APAF1O14727 1248 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 VILLO15195 856 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 OPHN1O60890 802 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 ULK1O75385 1050 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 INMTO95050 263 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 UNC5CO95185 931 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 SNAPINO95295 136 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 ITGA2P17301 1181 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 CYP3A5P20815 502 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 STX2P32856 288 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 ATP6V1E1P36543 226 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 STX17P56962 302 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 PRKCQQ04759 706 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 LGALS3BPQ08380 585 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 ODF1Q14990 250 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.15□□□□□ -1.431e-9■■■■■ 43.2
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 TMEM177Q53S58 311 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 GRTP1Q5TC63 336 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 BNIPLQ7Z465 357 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 CAMK1DQ8IU85 385 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 CENPSQ8N2Z9 138 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 TCAIMQ8N3R3 496 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 DTWD1Q8N5C7 304 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 CHST14Q8NCH0 376 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 OR6C4Q8NGE1 309 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 OR6S1Q8NH40 331 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 GRPEL2Q8TAA5 225 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 SCFD1Q8WVM8 642 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 FAR2Q96K12 515 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 LRGUKQ96M69 825 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 C7orf26Q96N11 449 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 TESK2Q96S53 571 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 YME1L1Q96TA2 773 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 WACQ9BTA9 647 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 NT5C3AQ9H0P0 336 aa6.15□□□□□ -1.43
ECHDC1-215ENST00000475319 TMEM60Q9H2L4 133 aa6.15□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms