RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM90A14PP0C7W9 464 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 IGFBP2P18065 325 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 TLE3Q04726 772 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP4.57□□□□□ -1.688e-13■■■■■ 39.8
RABGGTB-206ENST00000467748 PTGR1Q14914 329 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 DLGAP5Q15398 846 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 C6orf10Q5SRN2 563 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 RTL10Q7L3V2 364 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 MDGA2Q7Z553 956 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 WDR60Q8WVS4 1066 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 ATP2A3Q93084 1043 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 SFXN1Q9H9B4 322 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 MLXIPQ9HAP2 919 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 ERVK-5Q9HDB9 667 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 ARFGAP3Q9NP61 516 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 CNTN6Q9UQ52 1028 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 A0A087WV62 115 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 IKBKBO14920 756 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 FFAR2O15552 330 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 PLIN1O60240 522 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 OAZ2O95190 189 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 HOXB2P14652 356 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 BTKQ06187 659 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 RAPGEF1Q13905 1077 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 LRIG3Q6UXM1 1119 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 MORC1Q86VD1 984 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 GATAD2AQ86YP4 633 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 GPSM1Q86YR5 675 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 CCDC146Q8IYE0 955 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 NRSN1Q8IZ57 195 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM47BQ8NA70 645 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM71BQ8TC56 605 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM174Q8WUU8 243 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 HMGB4Q8WW32 186 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 HTATIP2Q9BUP3 242 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 TXNRD2Q9NNW7 524 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 SPAG4Q9NPE6 437 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 TBC1D3EA0A087X179 549 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 TBC1D3BA6NDS4 549 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 TBC1D3LB9A6J9 549 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 H0YGN5 161 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 CYP3A4P08684 503 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 TBC1D3HP0C7X1 549 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 CYP3A7P24462 503 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 P2RX3P56373 397 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 PTK2BQ14289 1009 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 PFKFB4Q16877 469 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF569Q5MCW4 686 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF527Q8NB42 609 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 INPP5DQ92835 1189 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 FANCD2Q9BXW9 1451 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 SMARCA4P51532 1647 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 FOXO6A8MYZ6 492 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 NEURL1O76050 574 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 TKTP29401 623 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 POLD2P49005 469 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 THBS3P49746 956 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 ISM2Q6H9L7 571 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 LIN54Q6MZP7 749 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 CYB5R4Q7L1T6 521 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 ATG16L2Q8NAA4 619 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 SCAMP5Q8TAC9 235 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 ADAMTS15Q8TE58 950 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 CRB3Q9BUF7 120 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF304Q9HCX3 659 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 DAPP1Q9UN19 280 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 SYNJ1O43426 1573 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-206ENST00000467748 MSI1O43347 362 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.5 ms