RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466971.1

NFX1-206, Transcript of nuclear transcription factor, X-box binding 1, human

TSL 5

Gene NFX1, Length 566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFX1-206	ENST00000466971	SGSM3	Q96HU1	749 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ZNF333	Q96JL9	665 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TSGA13	Q96PP4	275 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CYTH2	Q99418	400 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	MARCH5	Q9NX47	278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	MTRR	Q9UBK8	725 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TBX21	Q9UL17	535 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	PLXNA3	P51805	1871 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CEP350	Q5VT06	3117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TTC3	P53804	2025 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TLDC2	A0PJX2	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	MAGEB16	A2A368	324 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	MTMR11	A4FU01	709 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	KIAA0355	O15063	1070 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	MFSD11	O43934	449 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	FAM155B	O75949	473 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SUN1	O94901	812 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	EFEMP2	O95967	443 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CP	P00450	1065 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	IL2RA	P01589	272 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SOD2	P04179	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SHBG	P04278	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ITGB1	P05556	798 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	APRT	P07741	180 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ETS1	P14921	441 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TIMP2	P16035	220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	AMPD1	P23109	780 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CCNC	P24863	283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CNTF	P26441	200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	EPHB2	P29323	1055 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	MSH2	P43246	934 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	IFNAR2	P48551	515 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SLC11A1	P49279	550 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TUB	P50607	506 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	IRAK1	P51617	712 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	NDST2	P52849	883 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	GBE1	Q04446	702 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TLE2	Q04725	743 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	AP1B1	Q10567	949 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	FOXC1	Q12948	553 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CLN3	Q13286	438 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	GPNMB	Q14956	572 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TLR1	Q15399	786 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TRIM60	Q495X7	471 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	NPNT	Q6UXI9	565 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	LINC00523	Q86TU6	105 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	TMEM199	Q8N511	208 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	MEIOB	Q8N635	442 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	CCNY	Q8ND76	341 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	STKLD1	Q8NE28	680 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NFX1-206	ENST00000466971	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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