RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 ZBED6P86452 979 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 PLEKHG6Q3KR16 790 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC14Q49A88 953 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 FSCBQ5H9T9 825 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 PITRM1Q5JRX3 1037 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 DCUN1D2Q6PH85 259 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 VPS36Q86VN1 386 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 IGSF8Q969P0 613 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 TTC17Q96AE7 1141 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 ERLEC1Q96DZ1 483 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 LMLNQ96KR4 655 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 C1orf74Q96LT6 269 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 HAPLN3Q96S86 360 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 CD248Q9HCU0 757 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 SUN2Q9UH99 717 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 CAPN11Q9UMQ6 739 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP15.21■□□□□ 0.03
SH3BP1-205ENST00000466097 TMCO5BA8MYB1 307 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 EPN2O95208 641 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 GJB6O95452 261 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 SKILP12757 684 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 HLA-EP13747 358 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 SULT2A1Q06520 285 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 PTPRNQ16849 979 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 MAP7D1Q3KQU3 841 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 C5orf22Q49AR2 442 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 WDR59Q6PJI9 974 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 C14orf80Q86SX3 495 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 KIAA2013Q8IYS2 634 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 KDM1BQ8NB78 822 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 RNF214Q8ND24 703 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM172AQ8WUF8 416 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 CPLX3Q8WVH0 158 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 RLN3Q8WXF3 142 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 MRGPRX1Q96LB2 322 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 MCEEQ96PE7 176 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM245Q9H330 911 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 FBRSQ9HAH7 460 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 ANLNQ9NQW6 1124 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 TAS2R14Q9NYV8 317 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 USP18Q9UMW8 372 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 CHD5Q8TDI0 1954 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 RTN2O75298 545 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 SERPING1P05155 500 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 ACADMP11310 421 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 BCKDHBP21953 392 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 RRM1P23921 792 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 NNMTP40261 264 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 ECT2LQ008S8 904 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 TRIM14Q14142 442 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 PMS2CLQ68D20 193 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC36A4Q6YBV0 504 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 LPCAT2Q7L5N7 544 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 OR2T3Q8NH03 318 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 TRIM11Q96F44 468 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 SIPA1Q96FS4 1042 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 PARVAQ9NVD7 372 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 ERVW-1Q9UQF0 538 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 CEP250Q9BV73 2442 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 DRGXA6NNA5 263 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 E9PAM4 449 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 I6L893 689 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 SRGAP2O75044 1071 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 FTLP02792 175 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 GYPCP04921 128 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 TPM1P09493 284 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 ADRA1BP35368 520 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 IRAK1P51617 712 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 PLK1P53350 603 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 SPEM2Q0P670 501 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 SPDYCQ5MJ68 293 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 TMPRSS6Q8IU80 811 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 APCDD1Q8J025 514 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF366Q8N895 744 aa15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms