RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 I3L4J1 428 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 SYN3O14994 580 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 CYP26A1O43174 497 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 NPHS1O60500 1241 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 RFPL1O75677 317 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 AGFG2O95081 481 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 CDC25CP30307 473 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 SFNP31947 248 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 ALDH1A3P47895 512 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 IFNAR2P48551 515 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 CCT8P50990 548 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 SESN3P58005 492 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 SETQ01105 290 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 LAPTM5Q13571 262 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 SEC23AQ15436 765 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 GPR19Q15760 415 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 IGFBP7Q16270 282 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 LINC00303Q3SY05 128 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 CTXN3Q4LDR2 81 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 XKR3Q5GH77 459 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF280DQ6N043 979 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC27A1Q6PCB7 646 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 ITIH5Q86UX2 942 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 WFDC3Q8IUB2 231 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 NOSTRINQ8IVI9 506 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 TEX2Q8IWB9 1127 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 EXOC8Q8IYI6 725 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 RNF149Q8NC42 400 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 CLRN3Q8NCR9 226 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 ASB11Q8WXH4 323 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 DNASE2BQ8WZ79 361 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 PSMG2Q969U7 264 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 MISP3Q96FF7 219 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 MAP6Q96JE9 813 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 UROC1Q96N76 676 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 MTMR9Q96QG7 549 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 MMS19Q96T76 1030 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 YIPF4Q9BSR8 244 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 BOCQ9BWV1 1114 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 ANO3Q9BYT9 981 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 THSD1Q9NS62 852 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 TDP1Q9NUW8 608 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 ZIM2Q9NZV7 527 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 FBXL5Q9UKA1 691 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 VAV3Q9UKW4 847 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 SPO11Q9Y5K1 396 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 WNT6Q9Y6F9 365 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 TTC41PQ6P2S7 1318 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 PLXNA2O75051 1894 aa4.35□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 RP1P56715 2156 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 ERICH2A1L162 156 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM86B1E9PN63 330 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 LAD1O00515 517 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 DVL2O14641 736 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 PTGESO14684 152 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 ASAP2O43150 1006 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 PRC1O43663 620 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 MPOP05164 745 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM86B2P0C5J1 330 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 GABRG2P18507 467 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 DCTP40126 519 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 CASRP41180 1078 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 BRCC3P46736 316 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 ACADVLP49748 655 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 CLCNKBP51801 687 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 JAK3P52333 1124 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 CYP4F8P98187 520 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 DNAJC3Q13217 504 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 ILKQ13418 452 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 MTF1Q14872 753 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 TERF2Q15554 542 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 NAB2Q15742 525 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 UGCGQ16739 394 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 ARL13BQ3SXY8 428 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 EMC4Q5J8M3 183 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 PASD1Q8IV76 773 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 SIRT2Q8IXJ6 389 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 NAT16Q8N8M0 369 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 SH3RF2Q8TEC5 729 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 OSCP1Q8WVF1 389 aa4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
ECHDC1-211ENST00000460558 DLG3Q92796 817 aa4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms