RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 RXFP2Q8WXD0 754 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 PRSS16Q9NQE7 514 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 RRN3Q9NYV6 651 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 ADAM22Q9P0K1 906 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 ERVW-1Q9UQF0 538 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 GON4LQ3T8J9 2241 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 LRRC53A6NM62 1247 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 TTC34A8MYJ7 566 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF217O75362 1048 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 SERPINC1P01008 464 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 NSFP46459 744 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 STK19P49842 368 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 ARHGAP8P85298 464 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 PLEKHG6Q3KR16 790 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 LYSMD4Q5XG99 296 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP24.65■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 DNAAF5Q86Y56 855 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 OR2T3Q8NH03 318 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 DLL3Q9NYJ7 618 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 A0A1B0GVM2 712 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 DCDC2BA2VCK2 349 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 TCAF2A6NFQ2 919 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 FERP16591 822 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC14Q49A88 953 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 ALFQ53S48 1182 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 BRMS1LQ5PSV4 323 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 MAGEB5Q9BZ81 275 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 FSCN3Q9NQT6 498 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 ITM2CQ9NQX7 267 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 TAS2R14Q9NYV8 317 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
SH3BP5-208ENST00000459627 DNAH14Q0VDD8 3507 aa24.64■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 AP5Z1O43299 807 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 NDUFS2O75306 463 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 MOCS3O95396 460 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 TPMTP51580 245 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 ST8SIA6P61647 398 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 FANCCQ00597 558 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP24.63■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC36A4Q6YBV0 504 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 BNIPLQ7Z465 357 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 HSPA12BQ96MM6 686 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 MPP6Q9NZW5 540 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 TMCO5BA8MYB1 307 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 SIN3BO75182 1162 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 F9P00740 461 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 ASLP04424 464 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 ACADMP11310 421 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 CD6P30203 668 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 RDXP35241 583 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 RPS14P62263 151 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 ECT2LQ008S8 904 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 FOXK2Q01167 660 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF33AQ06730 810 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 NR1I3Q14994 352 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 E2F5Q15329 346 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 MON1BQ7L1V2 547 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF683Q8IZ20 524 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 NETO1Q8TDF5 533 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 GPR174Q9BXC1 333 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 C2CD4BA6NLJ0 364 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 SRGAP2O75044 1071 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 VAV1P15498 845 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 MAOBP27338 520 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 IRX4P78413 519 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 ASIC2Q16515 512 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 ARTNQ5T4W7 220 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 ALG14Q96F25 216 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 SYT11Q9BT88 431 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 SELENOOQ9BVL4 669 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 SUN2Q9UH99 717 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 A0A1W2PQC6 194 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 KRT3P12035 628 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 TNFAIP3P21580 790 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 SDC4P31431 198 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms