RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 ASPMQ8IZT6 3477 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A1B0GVM2 712 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 TCAF2A6NFQ2 919 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 MAP3K13O43283 966 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 PAGE1O75459 146 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 KCNK5O95279 499 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 ADCY5O95622 1261 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 EPHX1P07099 455 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 C1QTNF9P0C862 333 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 MPLP40238 635 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 CSKP41240 450 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 GSCP56915 257 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 CREB5Q02930 508 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 PTP4A2Q12974 167 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 AUHQ13825 339 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 PLA2G2CQ5R387 149 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC36A4Q6YBV0 504 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 LPCAT2Q7L5N7 544 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 BNIPLQ7Z465 357 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 CFAP57Q96MR6 1250 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 TKTL2Q9H0I9 626 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC6A17Q9H1V8 727 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 HS3ST4Q9Y661 456 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 GON4LQ3T8J9 2241 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 LRRC53A6NM62 1247 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 GIPC1O14908 333 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 MOCS3O95396 460 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 ASLP04424 464 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 PROS1P07225 676 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 HLA-EP13747 358 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 RDXP35241 583 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 GGCXP38435 758 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 NR1I3Q14994 352 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 C5orf22Q49AR2 442 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 PITRM1Q5JRX3 1037 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 SPDYCQ5MJ68 293 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 TMPRSS6Q8IU80 811 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 EMC1Q8N766 993 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 IGSF8Q969P0 613 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 ANLNQ9NQW6 1124 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 VPS45Q9NRW7 570 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 ADAM22Q9P0K1 906 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 VANGL2Q9ULK5 521 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 DOCK4Q8N1I0 1966 aa14.58□□□□□ -0.07
SH3BP4-205ENST00000444916 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 C2CD4BA6NLJ0 364 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 I6L893 689 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 AP5Z1O43299 807 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 CALB1P05937 261 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 SPINK2P20155 84 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 SDC4P31431 198 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 COPAP53621 1224 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 OXCT1P55809 520 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 FANCCQ00597 558 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC12A1Q13621 1099 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 PLEKHG6Q3KR16 790 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 MON1BQ7L1V2 547 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 CYP2U1Q7Z449 544 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEFF1Q8IYR6 380 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF366Q8N895 744 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 OR2T3Q8NH03 318 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 SIPA1Q96FS4 1042 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 SYT11Q9BT88 431 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 EDEM3Q9BZQ6 932 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 TTYH3Q9C0H2 523 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 SIK2Q9H0K1 926 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 FBRSQ9HAH7 460 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 CD93Q9NPY3 652 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 CYP8B1Q9UNU6 501 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 FASNP49327 2511 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP4-205ENST00000444916 CLDN11O75508 207 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms