RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441883.5

MRPL28-204, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 5

Gene MRPL28, Length 800 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-204	ENST00000441883	FOXC1	Q12948	553 aa		27.93	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		27.93	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	FBXL22	Q6P050	247 aa		27.93	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		27.93	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		27.93	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		27.93	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	USP24	Q9UPU5	2620 aa		27.93	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	MOCS3	O95396	460 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	SEMA4F	O95754	770 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	CYP11B1	P15538	503 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	SNX16	P57768	344 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	FAM193A	P78312	1265 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	ECT2L	Q008S8	904 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	SLC14A1	Q13336	389 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	RNF34	Q969K3	372 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	IGSF8	Q969P0	613 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	FAM129B	Q96TA1	746 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	UCHL3	P15374	230 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	IRAK1	P51617	712 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	PLK1	P53350	603 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	NME3	Q13232	169 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	SLC12A1	Q13621	1099 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	BIRC7	Q96CA5	298 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	NPY6R	Q99463	290 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	SYNC	Q9H7C4	482 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	SGK2	Q9HBY8	427 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	CEP83	Q9Y592	693 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883		A0A1B0GVM2	712 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883		M0QYT0	321 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	PDGFRA	P16234	1089 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	SPINK2	P20155	84 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	MATK	P42679	507 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	GABRB2	P47870	512 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	NUMB	P49757	651 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	USP30	Q70CQ3	517 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	C14orf80	Q86SX3	495 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	PTPRN2	Q92932	1015 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	NT5C3B	Q969T7	300 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	ALG14	Q96F25	216 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	SCML1	Q9UN30	329 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883		I6L893	689 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	SH3BP5	O60239	455 aa		27.89	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	PAGE1	O75459	146 aa		27.89	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	CENPC	Q03188	943 aa		27.89	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	CST6	Q15828	149 aa		27.89	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		27.89	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		27.89	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	STK33	Q9BYT3	514 aa		27.89	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	IL21R	Q9HBE5	538 aa		27.89	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		27.89	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		27.89	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	PIGV	Q9NUD9	493 aa		27.89	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		27.89	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		27.89	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		27.89	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	FRY	Q5TBA9	3013 aa		27.89	■■■□□ 2.06
MRPL28-204	ENST00000441883	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		27.88	■■■□□ 2.05
MRPL28-204	ENST00000441883	MID1	O15344	667 aa		27.88	■■■□□ 2.05
MRPL28-204	ENST00000441883	GGCX	P38435	758 aa		27.88	■■■□□ 2.05
MRPL28-204	ENST00000441883	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
MRPL28-204	ENST00000441883	ST3GAL2	Q16842	350 aa		27.88	■■■□□ 2.05
MRPL28-204	ENST00000441883	C5orf22	Q49AR2	442 aa		27.88	■■■□□ 2.05
MRPL28-204	ENST00000441883	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		27.88	■■■□□ 2.05
MRPL28-204	ENST00000441883	TAF3	Q5VWG9	929 aa		27.88	■■■□□ 2.05
MRPL28-204	ENST00000441883	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
MRPL28-204	ENST00000441883	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
MRPL28-204	ENST00000441883	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
MRPL28-204	ENST00000441883	GPT2	Q8TD30	523 aa		27.88	■■■□□ 2.05
MRPL28-204	ENST00000441883	SNX19	Q92543	992 aa		27.88	■■■□□ 2.05
MRPL28-204	ENST00000441883	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		27.88	■■■□□ 2.05
MRPL28-204	ENST00000441883	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05

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