RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440184.1

CBX1P1-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P1, Length 427 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P1-201ENST00000440184 FGF13Q92913 245 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 GTF3C6Q969F1 213 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 MTMR9Q96QG7 549 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 HSD17B14Q9BPX1 270 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 CLSTN3Q9BQT9 956 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 NFKBIZQ9BYH8 718 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 MEGF9Q9H1U4 602 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 C2orf42Q9NWW7 574 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 IGSF9Q9P2J2 1179 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 EPS15L1Q9UBC2 864 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 ADAM28Q9UKQ2 775 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa4.9□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 F5P12259 2224 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 CHD8Q9HCK8 2581 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 A0A0A6YYJ9 748 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 A0A1B0GUA9 196 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 BTBD18B2RXH4 712 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 DNAJC6O75061 913 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 MED24O75448 989 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 SOAT2O75908 522 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 BAG4O95429 457 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 PLATP00750 562 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 OR4Q2P0C623 313 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 MCM7P33993 719 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 VIPR2P41587 438 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 PXNP49023 591 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 GUCY2FP51841 1108 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 RRADP55042 308 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 NFKB2Q00653 900 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 ADCY2Q08462 1091 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 PCOLCEQ15113 449 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 NAB2Q15742 525 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 RNF151Q2KHN1 245 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 USP41Q3LFD5 358 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 STXBP5Q5T5C0 1151 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 TANGO2Q6ICL3 276 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 LILRA6Q6PI73 481 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 CYP26C1Q6V0L0 522 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 HACE1Q8IYU2 909 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 SUMF1Q8NBK3 374 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 WDR48Q8TAF3 677 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 HDAC7Q8WUI4 952 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 WASF1Q92558 559 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 STAMQ92783 540 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 ZFYVE19Q96K21 471 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 PGLYRP2Q96PD5 576 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 RTP3Q9BQQ7 232 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 COLEC11Q9BWP8 271 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 TMEM60Q9H2L4 133 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 PDZD7Q9H5P4 517 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 ANKEF1Q9NU02 776 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 KCMF1Q9P0J7 381 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 FNIP2Q9P278 1114 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 DPP7Q9UHL4 492 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 FBXW11Q9UKB1 542 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 PCDHA12Q9UN75 941 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 CDY1Q9Y6F8 540 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 USP24Q9UPU5 2620 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 SHISA7A6NL88 538 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 PP2D1A8MPX8 630 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 ANHXE9PGG2 379 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 MATN2O00339 956 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 GPR39O43194 453 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 LAMTOR5O43504 91 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 BRINP1O60477 761 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 KINO60870 393 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 OPHN1O60890 802 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 SEC24AO95486 1093 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 C1RP00736 705 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 MYL4P12829 197 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 CCR2P41597 374 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 CLCNKBP51801 687 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 ANAPC15P60006 121 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 PPP2CBP62714 309 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 PPP2CAP67775 309 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 SATB1Q01826 763 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1P1-201ENST00000440184 CREMQ03060 361 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms