RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 NAT8LQ8N9F0 302 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 ANKRD52Q8NB46 1076 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 CPT1BQ92523 772 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 RNF157Q96PX1 679 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 TBC1D17Q9HA65 648 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRRC4Q9HBW1 653 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM49BQ9NUQ9 324 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 HAUS2Q9NVX0 235 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMEM51Q9NW97 253 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 RRN3Q9NYV6 651 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 RAD54BQ9Y620 910 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 PTPRDP23468 1912 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 DENND4AQ7Z401 1863 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 C9IYK1 514 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 SNX3O60493 162 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATP5HO75947 161 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 FGFR1P11362 822 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 GLULP15104 373 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 EPCAMP16422 314 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 TPSB2P20231 275 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 TGM1P22735 817 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 CYP2F1P24903 491 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 CNTFP26441 200 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 RPL22P35268 128 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 FDFT1P37268 417 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 LHX1P48742 406 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 RGS7P49802 495 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 RASSF2P50749 326 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATP11AP98196 1134 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDK16Q00536 496 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCDC15Q0P6D6 951 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 NAB1Q13506 487 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 TPSAB1Q15661 275 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZBTB6Q15916 424 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 ARL13BQ3SXY8 428 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 BBS9Q3SYG4 887 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 PKDCCQ504Y2 493 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC45A4Q5BKX6 768 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 PPM1JQ5JR12 505 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC9A4Q6AI14 798 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 CCNJLQ8IV13 435 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 CRYBG2Q8N1P7 616 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM71DQ8N9W8 422 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 FBXO36Q8NEA4 188 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC35F5Q8WV83 523 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDKL2Q92772 493 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 MTBPQ96DY7 904 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 PAFAH2Q99487 392 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 NAT9Q9BTE0 207 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 APOL6Q9BWW8 343 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 PITPNM3Q9BZ71 974 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 CHST12Q9NRB3 414 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 RGS18Q9NS28 235 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 TXLNGQ9NUQ3 528 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 EURLQ9NYK6 297 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGSF9Q9P2J2 1179 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 CA14Q9ULX7 337 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.5□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 SHROOM3Q8TF72 1996 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 MIA3Q5JRA6 1907 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 GOLGA8MH3BSY2 632 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 AP3B1O00203 1094 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 PIRO00625 290 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPTLC1O15269 473 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 NCAM2O15394 837 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 MTSS1O43312 755 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRT38O76015 456 aa6.49□□□□□ -1.37
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