RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429174.6

DYSF-211, Transcript of dysferlin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene DYSF, Length 6,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSF-211ENST00000429174 NUAK2Q9H093 628 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 SLITRK2Q9H156 845 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 ARMC7Q9H6L4 198 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 WDR41Q9HAD4 459 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 CDHR5Q9HBB8 845 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 H7C4K7 107 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 KCNK1O00180 336 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 PGM3O95394 542 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 PRMT9Q6P2P2 845 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 UGT2B28Q9BY64 529 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 TMEM150BA6NC51 233 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 BANF1O75531 89 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 PGAM1P18669 254 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 IDH2P48735 452 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 SLC25A3Q00325 362 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 CDK16Q00536 496 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 NPNTQ6UXI9 565 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 TRIM63Q969Q1 353 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 SLC9A7Q96T83 725 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 CPNE1Q99829 537 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 TSPAN16Q9UKR8 245 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 GAKO14976 1311 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 A0A087WZ62 844 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 RARAP10276 462 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 CDH8P55286 799 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 RHAGQ02094 409 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 RALGDSQ12967 914 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 FAM20CQ8IXL6 584 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 PCDH9Q9HC56 1237 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 FAM50BQ9Y247 325 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 LRCH1Q9Y2L9 728 aa15.95■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 PSMG1O95456 288 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 KRT6AP02538 564 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 TYMPP19971 482 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 NDST1P52848 882 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 NR1D2Q14995 579 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 EXOC3L1Q86VI1 746 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 LINC00116Q8NCU8 138 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 STK32AQ8WU08 396 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 OSMRQ99650 979 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 MARC1Q5VT66 337 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 HERC6Q8IVU3 1022 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 C9orf16Q9BUW7 83 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 MED14O60244 1454 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 PIAS1O75925 651 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 SASH3O75995 380 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 SHBGP04278 402 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 ICAM1P05362 532 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 ADRA1DP25100 572 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 GPR15P49685 360 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 TUBP50607 506 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 MCOLN2Q8IZK6 566 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 CHST13Q8NET6 341 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 NUDT12Q9BQG2 462 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 NUDT5Q9UKK9 219 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 COQ6Q9Y2Z9 468 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 ARHGEF5Q12774 1597 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 GPR182O15218 404 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 NTRK1P04629 796 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 THP07101 528 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 PRLRP16471 622 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 ABATP80404 500 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 AP5B1Q2VPB7 878 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 SYT12Q8IV01 421 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 DEFB129Q9H1M3 183 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 OGDHLQ9ULD0 1010 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 SH3GLB1Q9Y371 365 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 SSNA1O43805 119 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 SLC25A27O95847 323 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 DBTP11182 482 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 ATP4AP20648 1035 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 BST2Q10589 180 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 SPANXN3Q5MJ09 141 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 PSMA8Q8TAA3 256 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 COL26A1Q96A83 441 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 PDCD10Q9BUL8 212 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 VTI1BQ9UEU0 232 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 NEO1Q92859 1461 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 OPLAHO14841 1288 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 NELFEP18615 380 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 LY6KQ17RY6 165 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 KLHL12Q53G59 568 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 POLNQ7Z5Q5 900 aa15.94■□□□□ 0.14
DYSF-211ENST00000429174 DEFB128Q7Z7B8 93 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms