RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 ACAP1Q15027 740 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM215Q68D42 235 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 SDE2Q6IQ49 451 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 RABEPKQ7Z6M1 372 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 UNC93AQ86WB7 457 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 MDM1Q8TC05 714 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 SORCS1Q8WY21 1168 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 GPR174Q9BXC1 333 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 CEP41Q9BYV8 373 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 FBXO44Q9H4M3 255 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 ITM2CQ9NQX7 267 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 PCDHA7Q9UN72 937 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 CLSTN1O94985 981 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 HMBSP08397 361 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 NCAM1P13591 858 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 TPMTP51580 245 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 AP3M2P53677 418 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 INCA1Q0VD86 236 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF234Q14588 700 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 COL28A1Q2UY09 1125 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 C10orf120Q5SQS8 335 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 DCAF12L1Q5VU92 463 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 RESP18Q5W5W9 173 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 GLRX5Q86SX6 157 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 CACUL1Q86Y37 369 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM174Q8WUU8 243 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 BTBD3Q9Y2F9 522 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 CKAP5Q14008 2032 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1B0GTW7 788 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 METTL12A8MUP2 240 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 MEI4A8MW99 385 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 MMP20O60882 483 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 CILPO75339 1184 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 IGLV3-19P01714 112 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 NR3C1P04150 777 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 RPN1P04843 607 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 TRIM49P0CI25 452 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 TRIM49CP0CI26 452 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 HLA-EP13747 358 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 PIK3CAP42336 1068 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 PPP3CAQ08209 521 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 WDR45BQ5MNZ6 344 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 SYCP2LQ5T4T6 812 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 DBX2Q6ZNG2 339 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 BHLHA9Q7RTU4 235 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC186Q7Z3E2 898 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 TMPRSS6Q8IU80 811 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF276Q8N554 614 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 TAS1R2Q8TE23 839 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 TAF4BQ92750 862 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 PAGE5Q96GU1 130 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 MUC3BQ9H195 1237 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 GAREM1Q9H706 876 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 MAGEF1Q9HAY2 307 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 PNPLA8Q9NP80 782 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 RASAL2Q9UJF2 1139 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.86□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 NUMA1Q14980 2115 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 LAMA5O15230 3695 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1B0GVT2 93 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 TULP2O00295 520 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 KCNK3O14649 394 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 GNSP15586 552 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 CD58P19256 250 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 GCLMP48507 274 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 GOLGA8FQ08AF8 430 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXD8-202ENST00000429017 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms