RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 NR1H3Q13133 447 aa21.21■□□□□ 0.99
HOXA4-202ENST00000428284 PPP2R5EQ16537 467 aa21.21■□□□□ 0.99
HOXA4-202ENST00000428284 MPP7Q5T2T1 576 aa21.21■□□□□ 0.99
HOXA4-202ENST00000428284 PCDH19Q8TAB3 1148 aa21.21■□□□□ 0.99
HOXA4-202ENST00000428284 TTC8Q8TAM2 541 aa21.21■□□□□ 0.99
HOXA4-202ENST00000428284 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa21.21■□□□□ 0.99
HOXA4-202ENST00000428284 P2RY11Q96G91 374 aa21.21■□□□□ 0.99
HOXA4-202ENST00000428284 RNF157Q96PX1 679 aa21.21■□□□□ 0.99
HOXA4-202ENST00000428284 OSBPL8Q9BZF1 889 aa21.21■□□□□ 0.99
HOXA4-202ENST00000428284 SHROOM3Q8TF72 1996 aa21.21■□□□□ 0.99
HOXA4-202ENST00000428284 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 CLDN11O75508 207 aa21.2■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 PENKP01210 267 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 GAD2Q05329 585 aa21.2■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 CDH18Q13634 790 aa21.2■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 TAZQ16635 292 aa21.2■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 CHST9Q7L1S5 443 aa21.2■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 MFN1Q8IWA4 741 aa21.2■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 CARNMT1Q8N4J0 409 aa21.2■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 HEMGNQ9BXL5 484 aa21.2■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 VCANP13611 3396 aa21.2■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 H0Y626 953 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 ARNTLO00327 626 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 CEP104O60308 925 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 TCP1P17987 556 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 OR1E1P30953 314 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 PTPN7P35236 360 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 DYNLT1P63172 113 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 TDGQ13569 410 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 TMCO3Q6UWJ1 677 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 NLRP14Q86W24 1093 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 PBKQ96KB5 322 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM248Q9NWD8 314 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 SAR1BQ9Y6B6 198 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 APOL1O14791 398 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 DCLK1O15075 740 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 TFDP2Q14188 446 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 PQLC3Q8N755 202 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 COG1Q8WTW3 980 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 ETNK2Q9NVF9 386 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 DONSONQ9NYP3 566 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 C19orf67A6NJJ6 358 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 WASH4PA8MWX3 477 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 NARSO43776 548 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 CST8O60676 142 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 MAPKAPK2P49137 400 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC181Q5TID7 509 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 NAT16Q8N8M0 369 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 HERPUD2Q9BSE4 406 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 RETREG1Q9H6L5 497 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 NDFIP2Q9NV92 336 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF212Q9UDV6 495 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa21.18■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 CACNG3O60359 315 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 TJP3O95049 919 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 PRLRP16471 622 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 SERPINB6P35237 376 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 ADCY2Q08462 1091 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 C6orf118Q5T5N4 469 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 SLC9A4Q6AI14 798 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 WFDC5Q8TCV5 224 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 DNASE1L2Q92874 299 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 CLEC4EQ9ULY5 219 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 EFR3BQ9Y2G0 817 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 CES2O00748 559 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF185O15231 689 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 RHOCP08134 193 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 SRFP11831 508 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 GJA4P35212 333 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 AMPD2Q01433 879 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 PFKPQ01813 784 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 RNF43Q68DV7 783 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 BBS12Q6ZW61 710 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 NPWQ8N729 165 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 PLD5Q8N7P1 536 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 KIF18AQ8NI77 898 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa21.16■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 MFSD11O43934 449 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 FGGP02679 453 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 FSCBQ5H9T9 825 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXA4-202ENST00000428284 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms