RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM167AQ96KS9 214 aa18.78■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 CATSPER2Q96P56 530 aa18.78■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 B3GNT5Q9BYG0 378 aa18.78■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF696Q9H7X3 374 aa18.78■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF408Q9H9D4 720 aa18.78■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa18.78■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 SOCS7O14512 581 aa18.78■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 DCXO43602 365 aa18.78■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 CDK4P11802 303 aa18.78■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 PACS1Q6VY07 963 aa18.78■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 MIPOL1Q8TD10 442 aa18.78■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 ACMSDQ8TDX5 336 aa18.78■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP18.78■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 RTKNQ9BST9 563 aa18.78■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 CYP3A43Q9HB55 503 aa18.78■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 TNFSF13BQ9Y275 285 aa18.78■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa18.78■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa18.78■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 GLTPD2A6NH11 291 aa18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 MDM4O15151 490 aa18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 ADCY6O43306 1168 aa18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBTB14O43829 449 aa18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 TNFAIP8O95379 198 aa18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 PRKCGP05129 697 aa18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 CYP2C8P10632 490 aa18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 GRK2P25098 689 aa18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 BSPRYQ5W0U4 402 aa18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 NETO2Q8NC67 525 aa18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 CNBD2Q96M20 576 aa18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 MAF1Q9H063 256 aa18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 APPL1Q9UKG1 709 aa18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 AP4B1Q9Y6B7 739 aa18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 EVPLQ92817 2033 aa18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 SRGAP2BP0DMP2 458 aa18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 CLCN2P51788 898 aa18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 NIPAL4Q0D2K0 466 aa18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 KLF10Q13118 480 aa18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 GK3PQ14409 553 aa18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 TBCBQ99426 244 aa18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM49BQ9NUQ9 324 aa18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF358Q9NW07 568 aa18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 DCDC2Q9UHG0 476 aa18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 PACSIN3Q9UKS6 424 aa18.77■□□□□ 0.6
RALGPS1-208ENST00000424082 DPYSL4O14531 572 aa18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 P4HA1P13674 534 aa18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 HARS2P49590 506 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 INCA1Q0VD86 236 aa18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 SEMA5AQ13591 1074 aa18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 STILQ15468 1287 aa18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 GPR162Q16538 588 aa18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 FSCBQ5H9T9 825 aa18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 TTC30AQ86WT1 665 aa18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 LRGUKQ96M69 825 aa18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM216Q9P0N5 145 aa18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 STK39Q9UEW8 545 aa18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 GAS2O43903 313 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 ALDH1A2O94788 518 aa18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 ATICP31939 592 aa18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 ADGRE1Q14246 886 aa18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 EFCAB12Q6NXP0 572 aa18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP2A3Q93084 1043 aa18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 CPB2Q96IY4 423 aa18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 PGLYRP2Q96PD5 576 aa18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 GPR20Q99678 358 aa18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 NT5C1AQ9BXI3 368 aa18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 RNPEPQ9H4A4 650 aa18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 MCM3APO60318 1980 aa18.76■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGAP10A1A4S6 786 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 NOP56O00567 594 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 GABBR2O75899 941 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 PCSK6P29122 969 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC6A3Q01959 620 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 APOFQ13790 326 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC10A6Q3KNW5 377 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 LDLRAD1Q5T700 205 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 STEAP4Q687X5 459 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 IYDQ6PHW0 289 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 C4orf22Q6V702 233 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 TICAM1Q8IUC6 712 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 GAB3Q8WWW8 586 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 LGMNQ99538 433 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 CEP41Q9BYV8 373 aa18.75■□□□□ 0.59
RALGPS1-208ENST00000424082 VRTNQ9H8Y1 702 aa18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms