RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 GOLGA8HP0CJ92 632 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 CTGFP29279 349 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 CYP2C18P33260 490 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 MCM5P33992 734 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 SLC16A2P36021 539 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 SLC1A4P43007 532 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 PSMC4P43686 418 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 TUBA4AP68366 448 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 COG2Q14746 738 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 WTAPQ15007 396 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 NECTIN1Q15223 517 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 FAM110CQ1W6H9 321 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 PLEKHG6Q3KR16 790 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 ADCK5Q3MIX3 580 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 LONRF3Q496Y0 759 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 CCDC174Q6PII3 467 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 C17orf99Q6UX52 265 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 CATIPQ7Z7H3 387 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 CPXCR1Q8N123 301 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 LPAR1Q92633 364 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 SLF1Q9BQI6 1058 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 TTYH3Q9C0H2 523 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 PORCNQ9H237 461 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 CPVLQ9H3G5 476 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 NRIP3Q9NQ35 241 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 DUSP22Q9NRW4 184 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 SERTAD3Q9UJW9 196 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 SNX14Q9Y5W7 946 aa5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 MYH15Q9Y2K3 1946 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRK-209ENST00000415046 RXRAP19793 462 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRK-209ENST00000415046 HSPA4P34932 840 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 STAT2P52630 851 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 MAPK7Q13164 816 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 LAYNQ6UX15 382 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 CHURC1Q8WUH1 139 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRK-209ENST00000415046 LY9Q9HBG7 655 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 VAT1LQ9HCJ6 419 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 HOMER2Q9NSB8 354 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 MORF4L1Q9UBU8 362 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 FEM1BQ9UK73 627 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 GABRQQ9UN88 632 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRK-209ENST00000415046 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 ADAMTS3O15072 1205 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 ZBED4O75132 1171 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 UNC5CO95185 931 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 IL33O95760 270 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 PDHBP11177 359 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 HDCP19113 662 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 MPGP29372 298 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 PTGER1P34995 402 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 PXNP49023 591 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 SOX8P57073 446 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 LILRA4P59901 499 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 CCNA1P78396 465 aa4.98□□□□□ -1.61
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PTPRK-209ENST00000415046 ZNF543Q08ER8 600 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 KRT32Q14532 448 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 GRM4Q14833 912 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 IQCB1Q15051 598 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 ARHGEF6Q15052 776 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 ETFDHQ16134 617 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 ASPRV1Q53RT3 343 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 ARHGAP40Q5TG30 622 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRK-209ENST00000415046 BHLHA9Q7RTU4 235 aa4.98□□□□□ -1.61
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