RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413522.1

SNORD56-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 71 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56-201ENST00000413522 GORABQ5T7V8 394 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 SHC4Q6S5L8 630 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 ZNF793Q6ZN11 406 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 TMEM200AQ86VY9 491 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 NANOGP1Q8N7R0 232 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 OR52N4Q8NGI2 321 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 THAP4Q8WY91 577 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 ATP2A3Q93084 1043 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 RILPL2Q969X0 211 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 VOPP1Q96AW1 172 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 SDCCAG3Q96C92 435 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 ISCA1Q9BUE6 129 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 PLEKHA2Q9HB19 425 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 G6PC2Q9NQR9 355 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 MTMR4Q9NYA4 1195 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.921e-323■□□□□ 11.3
SNORD56-201ENST00000413522 RCE1Q9Y256 329 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 TNFSF13BQ9Y275 285 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 MCIDASD6RGH6 385 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 F8W810 466 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 MSI1O43347 362 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 TLR2O60603 784 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 TFRCP02786 760 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 CHN1P15882 459 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 PRPH2P23942 346 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 MCM2P49736 904 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 OAZ1P54368 228 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 ADPRHP54922 357 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 PPFIA1Q13136 1202 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 BIRC3Q13489 604 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 PGM5Q15124 567 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 RABEP1Q15276 862 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 ETFDHQ16134 617 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 PXDC1Q5TGL8 231 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 LRIG3Q6UXM1 1119 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 DEF8Q6ZN54 512 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 RASGRP2Q7LDG7 609 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 MDGA2Q7Z553 956 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 ZNF354CQ86Y25 554 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 C2CD5Q86YS7 1000 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 SMC5Q8IY18 1101 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 EXOC8Q8IYI6 725 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 VPS52Q8N1B4 723 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 TMEM57Q8N5G2 664 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 EXD3Q8N9H8 876 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 SPPL3Q8TCT6 385 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 IP6K1Q92551 441 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 NPAS1Q99742 590 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 TUBB6Q9BUF5 446 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 HDHD5Q9BXW7 423 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 TRIM31Q9BZY9 425 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 TWSG1Q9GZX9 223 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 CLPBQ9H078 707 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 MYH16Q9H6N6 1097 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 RMI1Q9H9A7 625 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 ARL15Q9NXU5 204 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 FEM1BQ9UK73 627 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 UTS2RQ9UKP6 389 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 FBXO4Q9UKT5 387 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 GPR52Q9Y2T5 361 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 DERAQ9Y315 318 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 PCSK5Q92824 1860 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 CXorf65A6NEN9 183 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 NPIPB13A6NJU9 1138 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 NPIPB5A8MRT5 1133 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 NPIPB4C9JG80 1138 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 RHODO00212 210 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 STX16O14662 325 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP3.03□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 FGBP02675 491 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 TK1P04183 234 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 LYL1P12980 280 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 ACP5P13686 325 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 PKMP14618 531 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 GSTM2P28161 218 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 PNPLA4P41247 253 aa3.03□□□□□ -1.92
SNORD56-201ENST00000413522 PLCD1P51178 756 aa3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms