RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC2A3P11169 496 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP5-204ENST00000412806 BRAFP15056 766 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP5-204ENST00000412806 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SH3BP5-204ENST00000412806 CDK16Q00536 496 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP5-204ENST00000412806 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
SH3BP5-204ENST00000412806 FOXR1Q6PIV2 292 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP5-204ENST00000412806 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP5-204ENST00000412806 TRABD2AQ86V40 505 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP5-204ENST00000412806 MIB1Q86YT6 1006 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP5-204ENST00000412806 DPF3Q92784 378 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP5-204ENST00000412806 C1orf74Q96LT6 269 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP5-204ENST00000412806 PAFAH2Q99487 392 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM51Q9NW97 253 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP5-204ENST00000412806 MPP6Q9NZW5 540 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP5-204ENST00000412806 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
SH3BP5-204ENST00000412806 TTLL3Q9Y4R7 772 aa22.14■■□□□ 1.14
SH3BP5-204ENST00000412806 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 DFFAO00273 331 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 MTSS1O43312 755 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 CPP00450 1065 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 SARNPP82979 210 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 TTLL2Q9BWV7 592 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 CCSER2Q9H7U1 834 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 MARCH2Q9P0N8 246 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 ACTL7BQ9Y614 415 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 SEC24AO95486 1093 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 APOEP02649 317 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 ACRP10323 421 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 CD68P34810 354 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 MS4A13Q5J8X5 152 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 ADGRD1Q6QNK2 874 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF683Q8IZ20 524 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 DCAKDQ8WVC6 231 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 AGAP3Q96P47 875 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 CYTH2Q99418 400 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC39A8Q9C0K1 460 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 KCNK9Q9NPC2 374 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC12A8A0AV02 714 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 KIAA0355O15063 1070 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 C1QAP02745 245 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 HMBSP08397 361 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 MLNP12872 115 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 COG7P83436 770 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 NR1H3Q13133 447 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 TEX44Q53QW1 395 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 LRRC8BQ6P9F7 803 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM169Q96HH4 297 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 VANGL2Q9ULK5 521 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 RAG1P15918 1043 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 KRT15P19012 456 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 MSH2P43246 934 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 TUFMP49411 452 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 DSG1Q02413 1049 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 MPP2Q14168 576 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 SPARCL1Q14515 664 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 UNC5AQ6ZN44 842 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 NLRP14Q86W24 1093 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 LZTR1Q8N653 840 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 GBA3Q9H227 469 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 RSPH14Q9UHP6 348 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 TRHDEQ9UKU6 1024 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 GMNCA6NCL1 334 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 TLR5O60602 858 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 JCHAINP01591 159 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 IGLV3-27P01718 113 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 STX2P32856 288 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF33AQ06730 810 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 ATPAF2Q8N5M1 289 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 ANKRD42Q8N9B4 389 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 MGARPQ8TDB4 240 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 TSGA13Q96PP4 275 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 VAT1Q99536 393 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 KIF9Q9HAQ2 790 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A1W2PPM1 405 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 WASH4PA8MWX3 477 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 ABLIM3O94929 683 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 NFKB1P19838 968 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 CCNCP24863 283 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 OLIG2Q13516 323 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP5-204ENST00000412806 AFMIDQ63HM1 303 aa22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms