RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 FUT6P51993 359 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 MECOMQ03112 1051 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC20A2Q08357 652 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF174Q15697 407 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 C3AR1Q16581 482 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM177Q53S58 311 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 C2CD6Q53TS8 623 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGFL1Q6UW32 110 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC9B2Q86UD5 537 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 TXNDC2Q86VQ3 553 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLD3Q8IV08 490 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 LYSMD2Q8IV50 215 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPR156Q8NFN8 814 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 TYMSOSQ8TAI1 123 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 RSPRY1Q96DX4 576 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 KAZALD1Q96I82 304 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SERAC1Q96JX3 654 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 TINF2Q9BSI4 451 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PANK2Q9BZ23 570 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 GORASP2Q9H8Y8 452 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPAG4Q9NPE6 437 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRT84Q9NSB2 600 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM181Q9P2C4 612 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PARP2Q9UGN5 583 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAD54BQ9Y620 910 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDY2AQ9Y6F7 541 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF840PA6NDX5 716 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 MARCH6O60337 910 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PMPCBO75439 489 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 DEDDO75618 318 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNFRSF6BO95407 300 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ERVK-10P10266 1014 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF44P15621 663 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPS2P15880 293 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHRM3P20309 590 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDCP20941 246 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 COL8A2P25067 703 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 HOXC8P31273 242 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 GKP32189 559 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 FMO5P49326 533 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 BMXP51813 675 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB39AQ14964 217 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PGM5Q15124 567 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 DUSP6Q16828 381 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC10A6Q3KNW5 377 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 TUBB8Q3ZCM7 444 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 XKR9Q5GH70 373 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 HMBOX1Q6NT76 420 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARMCX5Q6P1M9 558 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM180AQ6UWF9 173 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM108Q6UXF1 575 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINC00336Q6ZUF6 198 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 HS2ST1Q7LGA3 356 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 VASH2Q86V25 355 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SFR1Q86XK3 245 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 UEVLDQ8IX04 471 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 AOPEPQ8N6M6 819 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 BADQ92934 168 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 DHX58Q96C10 678 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 NUS1Q96E22 293 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPATA32Q96LK8 384 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 APOLD1Q96LR9 279 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ORAI3Q9BRQ5 295 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 CNPPD1Q9BV87 410 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PACSIN1Q9BY11 444 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PANK3Q9H999 370 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 GGT7Q9UJ14 662 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF180Q9UJW8 692 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 LAMP3Q9UQV4 416 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 C2CD2Q9Y426 696 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa-0.76□□□□□ -2.53
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