RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 NTSR1P30989 418 aa24.56■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 CDH4P55283 916 aa24.56■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 CRY1Q16526 586 aa24.56■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 EFHC2Q5JST6 749 aa24.56■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 EOGTQ5NDL2 527 aa24.56■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM92Q6UXU6 159 aa24.56■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa24.56■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM86C1Q9NVL1 165 aa24.56■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 DMDP11532 3685 aa24.56■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 TIMM44O43615 452 aa24.55■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 LRCH4O75427 683 aa24.55■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 MIPP30301 263 aa24.55■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 CSKP41240 450 aa24.55■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 PXNP49023 591 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF528Q3MIS6 628 aa24.55■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 APCDD1Q8J025 514 aa24.55■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 OR52K2Q8NGK3 314 aa24.55■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 ERLEC1Q96DZ1 483 aa24.55■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 PEBP4Q96S96 227 aa24.55■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa24.55■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 IMPACTQ9P2X3 320 aa24.55■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 DOCK4Q8N1I0 1966 aa24.55■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 LRIG2O94898 1065 aa24.54■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 AIF1P55008 147 aa24.54■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF234Q14588 700 aa24.54■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 PITRM1Q5JRX3 1037 aa24.54■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 MANEALQ5VSG8 457 aa24.54■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 SDE2Q6IQ49 451 aa24.54■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 ZYG11BQ9C0D3 744 aa24.54■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 IP6K2Q9UHH9 426 aa24.54■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 STON1Q9Y6Q2 735 aa24.54■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 SOWAHDA6NJG2 315 aa24.54■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 HOXB2P14652 356 aa24.54■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 FECHP22830 423 aa24.54■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 IL12RB1P42701 662 aa24.54■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 PLEKHG6Q3KR16 790 aa24.54■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 CCDC170Q8IYT3 715 aa24.54■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa24.54■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 OSGEPQ9NPF4 335 aa24.54■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 UVRAGQ9P2Y5 699 aa24.54■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa24.54■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 RAD54BQ9Y620 910 aa24.54■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 MYO1FO00160 1098 aa24.53■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 PRPSAP2O60256 369 aa24.53■■□□□ 1.52
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UBE2E3-202ENST00000410062 TCF4P15884 667 aa24.53■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 FNTBP49356 437 aa24.53■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 ACAP1Q15027 740 aa24.53■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 PTPRNQ16849 979 aa24.53■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 TSTD1Q8NFU3 115 aa24.53■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 TTC17Q96AE7 1141 aa24.53■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 GABRG3Q99928 467 aa24.53■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 USP18Q9UMW8 372 aa24.53■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 PLA2G4CQ9UP65 541 aa24.53■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 AP4E1Q9UPM8 1137 aa24.53■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 NEU3Q9UQ49 428 aa24.53■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 MOCS3O95396 460 aa24.52■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 DLDP09622 509 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 OR1E1P30953 314 aa24.52■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 L1CAMP32004 1257 aa24.52■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 DGKEP52429 567 aa24.52■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC12A1Q13621 1099 aa24.52■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 CA9Q16790 459 aa24.52■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 ERMARDQ5T6L9 678 aa24.52■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 TMTC1Q8IUR5 882 aa24.52■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 CAMKK1Q8N5S9 505 aa24.52■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 NIPA2Q8N8Q9 360 aa24.52■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 NELL1Q92832 810 aa24.52■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 TBC1D31Q96DN5 1066 aa24.52■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 ZSCAN32Q9NX65 697 aa24.52■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF212Q9UDV6 495 aa24.52■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 R4GN57 208 aa24.52■■□□□ 1.52
UBE2E3-202ENST00000410062 A0A1W2PQF6 199 aa24.51■■□□□ 1.51
UBE2E3-202ENST00000410062 NPC1O15118 1278 aa24.51■■□□□ 1.51
UBE2E3-202ENST00000410062 CREB3O43889 395 aa24.51■■□□□ 1.51
UBE2E3-202ENST00000410062 LCA5LO95447 670 aa24.51■■□□□ 1.51
UBE2E3-202ENST00000410062 APBB3O95704 486 aa24.51■■□□□ 1.51
UBE2E3-202ENST00000410062 RHOCP08134 193 aa24.51■■□□□ 1.51
UBE2E3-202ENST00000410062 PCK1P35558 622 aa24.51■■□□□ 1.51
UBE2E3-202ENST00000410062 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
UBE2E3-202ENST00000410062 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
UBE2E3-202ENST00000410062 NRLP54845 237 aa24.51■■□□□ 1.51
UBE2E3-202ENST00000410062 OXCT1P55809 520 aa24.51■■□□□ 1.51
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