RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401394.5

CTCF-202, Transcript of CCCTC-binding factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCF, Length 2,978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCF-202ENST00000401394 MTTPP55157 894 aa21.49■■□□□ 1.03
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CTCF-202ENST00000401394 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
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CTCF-202ENST00000401394 STRA8Q7Z7C7 330 aa21.48■■□□□ 1.03
CTCF-202ENST00000401394 PQLC1Q8N2U9 271 aa21.48■■□□□ 1.03
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CTCF-202ENST00000401394 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa21.47■■□□□ 1.03
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CTCF-202ENST00000401394 CLPTM1O96005 669 aa21.46■■□□□ 1.03
CTCF-202ENST00000401394 SRGAP2BP0DMP2 458 aa21.46■■□□□ 1.03
CTCF-202ENST00000401394 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CTCF-202ENST00000401394 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CTCF-202ENST00000401394 EPGNQ6UW88 154 aa21.46■■□□□ 1.03
CTCF-202ENST00000401394 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa21.46■■□□□ 1.03
CTCF-202ENST00000401394 SGF29Q96ES7 293 aa21.46■■□□□ 1.03
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