RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394744.6

RAB11FIP4-201, Transcript of RAB11 family interacting protein 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RAB11FIP4, Length 1,968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 COL6A1P12109 1028 aa20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CD68P34810 354 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 BMPR2Q13873 1038 aa20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CEP57Q86XR8 500 aa20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ABI1Q8IZP0 508 aa20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PGLYRP2Q96PD5 576 aa20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HAPLN3Q96S86 360 aa20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 OSER1Q9NX31 292 aa20.39■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SYN3O14994 580 aa20.38■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MTSS1O43312 755 aa20.38■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PGAM1P18669 254 aa20.38■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CCR1P32246 355 aa20.38■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CDK7P50613 346 aa20.38■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 LGSNQ5TDP6 509 aa20.38■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GGT7Q9UJ14 662 aa20.38■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ADAM28Q9UKQ2 775 aa20.38■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20.38■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 EDF1O60869 148 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KRT38O76015 456 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ALDH1A2O94788 518 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 AP2A1O95782 977 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ALADP13716 330 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CTXN3Q4LDR2 81 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CYS1Q717R9 158 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FAM126BQ8IXS8 530 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 NUP93Q8N1F7 819 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZNF276Q8N554 614 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 OR52K1Q8NGK4 314 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 B3GALT6Q96L58 329 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 C8orf48Q96LL4 319 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FAM111AQ96PZ2 611 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GBA3Q9H227 469 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 STARD13Q9Y3M8 1113 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 USP12O75317 370 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 NFKB1P19838 968 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SCTRP47872 440 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 BFSP2Q13515 415 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CRYMQ14894 314 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TEX44Q53QW1 395 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CCNJLQ8IV13 435 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CCDC63Q8NA47 563 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DPF3Q92784 378 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CASD1Q96PB1 797 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 GPR62Q9BZJ7 368 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HCSTQ9UBK5 93 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TRHDEQ9UKU6 1024 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SCML2Q9UQR0 700 aa20.37■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 COPEO14579 308 aa20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RFPL1O75677 317 aa20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ETV4P43268 484 aa20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 USP46P62068 366 aa20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 PPP2R5DQ14738 602 aa20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MANEALQ5VSG8 457 aa20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TTC9BQ8N6N2 239 aa20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ATAD1Q8NBU5 361 aa20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TTC17Q96AE7 1141 aa20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SLC17A6Q9P2U8 582 aa20.36■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HMX2A2RU54 273 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DFFAO00273 331 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 JCHAINP01591 159 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 DHRS4L1P0CG22 281 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 HOXC13P31276 330 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SERPINB9P50453 376 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 COG7P83436 770 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MGAT5Q09328 741 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TCTN1Q2MV58 587 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ARTNQ5T4W7 220 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MROH9Q5TGP6 573 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 KCTD11Q693B1 232 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MON1AQ86VX9 555 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TBC1D31Q96DN5 1066 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 MTBPQ96DY7 904 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 RMDN2Q96LZ7 410 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 TEKT5Q96M29 485 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 VAT1Q99536 393 aa20.35■□□□□ 0.85
RAB11FIP4-201ENST00000394744 NAT9Q9BTE0 207 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms