RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 MTG2Q9H4K7 406 aa27.82■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 MPP6Q9NZW5 540 aa27.82■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa27.82■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa27.82■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP27.82■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 SERPING1P05155 500 aa27.81■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 GZMAP12544 262 aa27.81■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 PLEKHG6Q3KR16 790 aa27.81■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 HAPLN3Q96S86 360 aa27.81■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP27.81■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 USP34Q70CQ2 3546 aa27.8■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 E9PAM4 449 aa27.8■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 NPC1O15118 1278 aa27.8■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 RTN2O75298 545 aa27.8■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 EPHX1P07099 455 aa27.8■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 ADRA1BP35368 520 aa27.8■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 P2RY2P41231 377 aa27.8■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa27.8■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 GAS2L3Q86XJ1 694 aa27.8■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 RUBCNQ92622 972 aa27.8■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF653Q96CK0 615 aa27.8■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 ALG14Q96F25 216 aa27.8■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 MRGPRX1Q96LB2 322 aa27.8■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 C1orf74Q96LT6 269 aa27.8■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 ISCUQ9H1K1 167 aa27.8■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa27.79■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 A0A087X0T9 212 aa27.79■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 DRGXA6NNA5 263 aa27.79■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 FAM72CH0Y354 149 aa27.79■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 FAM228BP0C875 321 aa27.79■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 STARD3Q14849 445 aa27.79■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 MAP7D1Q3KQU3 841 aa27.79■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 PLK5Q496M5 336 aa27.79■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 FAM72AQ5TYM5 149 aa27.79■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 FAM72DQ6L9T8 149 aa27.79■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa27.79■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 DCUN1D2Q6PH85 259 aa27.79■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa27.79■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 FAM72BQ86X60 149 aa27.79■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 CACUL1Q86Y37 369 aa27.79■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 HINFPQ9BQA5 517 aa27.79■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 NCDNQ9UBB6 729 aa27.79■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 RAB23Q9ULC3 237 aa27.79■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 PLA2G4CQ9UP65 541 aa27.79■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 SRGAP2O75044 1071 aa27.78■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 COPAP53621 1224 aa27.78■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 CDH4P55283 916 aa27.78■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 LAIR1Q6GTX8 287 aa27.78■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 PARVAQ9NVD7 372 aa27.78■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 MYO1AQ9UBC5 1043 aa27.78■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 NEU3Q9UQ49 428 aa27.78■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 OR51B4Q9Y5P0 310 aa27.78■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 PIEZO1Q92508 2521 aa27.77■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 CLDN11O75508 207 aa27.77■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 STK19P49842 368 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 MANEALQ5VSG8 457 aa27.77■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 SARM1Q6SZW1 724 aa27.77■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 CNPY3Q9BT09 278 aa27.77■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM51Q9NW97 253 aa27.77■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF212Q9UDV6 495 aa27.77■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 NENFQ9UMX5 172 aa27.77■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 ERVW-1Q9UQF0 538 aa27.77■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa27.77■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 EML5Q05BV3 1969 aa27.77■■■□□ 2.04
TPGS1-201ENST00000359315 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
TPGS1-201ENST00000359315 ASLP04424 464 aa27.76■■■□□ 2.03
TPGS1-201ENST00000359315 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM14Q14142 442 aa27.76■■■□□ 2.03
TPGS1-201ENST00000359315 SCYL2Q6P3W7 929 aa27.76■■■□□ 2.03
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC31Q6UY01 552 aa27.76■■■□□ 2.03
TPGS1-201ENST00000359315 TMC6Q7Z403 805 aa27.76■■■□□ 2.03
TPGS1-201ENST00000359315 PYROXD2Q8N2H3 581 aa27.76■■■□□ 2.03
TPGS1-201ENST00000359315 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa27.76■■■□□ 2.03
TPGS1-201ENST00000359315 NTAN1Q96AB6 310 aa27.76■■■□□ 2.03
TPGS1-201ENST00000359315 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
TPGS1-201ENST00000359315 DNAJC7Q99615 494 aa27.76■■■□□ 2.03
TPGS1-201ENST00000359315 PARD6AQ9NPB6 346 aa27.76■■■□□ 2.03
TPGS1-201ENST00000359315 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa27.76■■■□□ 2.03
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD62A6NC57 917 aa27.75■■■□□ 2.03
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM191CA6NGB0 347 aa27.75■■■□□ 2.03
TPGS1-201ENST00000359315 TTC34A8MYJ7 566 aa27.75■■■□□ 2.03
TPGS1-201ENST00000359315 MOCS3O95396 460 aa27.75■■■□□ 2.03
TPGS1-201ENST00000359315 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms