RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 M0R2N6 131 aa21.15■□□□□ 0.98
NISCH-201ENST00000345716 TUFMP49411 452 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
NISCH-201ENST00000345716 EXOC3L1Q86VI1 746 aa21.15■□□□□ 0.98
NISCH-201ENST00000345716 HORMAD1Q86X24 394 aa21.15■□□□□ 0.98
NISCH-201ENST00000345716 VTI1BQ9UEU0 232 aa21.15■□□□□ 0.98
NISCH-201ENST00000345716 RAD54BQ9Y620 910 aa21.15■□□□□ 0.98
NISCH-201ENST00000345716 FKBP6O75344 327 aa21.14■□□□□ 0.98
NISCH-201ENST00000345716 PIAS1O75925 651 aa21.14■□□□□ 0.98
NISCH-201ENST00000345716 ATP6V1E1P36543 226 aa21.14■□□□□ 0.98
NISCH-201ENST00000345716 IQCKQ8N0W5 287 aa21.14■□□□□ 0.98
NISCH-201ENST00000345716 POU5F2Q8N7G0 328 aa21.14■□□□□ 0.98
NISCH-201ENST00000345716 ZNF556Q9HAH1 456 aa21.14■□□□□ 0.98
NISCH-201ENST00000345716 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa21.14■□□□□ 0.98
NISCH-201ENST00000345716 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
NISCH-201ENST00000345716 CLDN5O00501 218 aa21.14■□□□□ 0.98
NISCH-201ENST00000345716 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.98
NISCH-201ENST00000345716 TSHRP16473 764 aa21.14■□□□□ 0.98
NISCH-201ENST00000345716 MYLPFQ96A32 169 aa21.14■□□□□ 0.98
NISCH-201ENST00000345716 SIKE1Q9BRV8 207 aa21.14■□□□□ 0.98
NISCH-201ENST00000345716 CIPCQ9C0C6 399 aa21.14■□□□□ 0.98
NISCH-201ENST00000345716 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa21.14■□□□□ 0.98
NISCH-201ENST00000345716 SPEF2Q9C093 1822 aa21.14■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 MAGEA13PA6NCF6 341 aa21.14■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 CAAP1Q9H8G2 361 aa21.14■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 ICAM3P32942 547 aa21.14■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 MATKP42679 507 aa21.14■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 PEX5P50542 639 aa21.14■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 WASHC2DQ5SRD0 308 aa21.14■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 LRRC57Q8N9N7 239 aa21.14■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 JADE3Q92613 823 aa21.14■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 TAS2R13Q9NYV9 303 aa21.14■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 ALBP02768 609 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 NFKB1P19838 968 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 UROC1Q96N76 676 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 LGMNQ99538 433 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 DMAC2Q9NW81 257 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 CLCA2Q9UQC9 943 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 STARD13Q9Y3M8 1113 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 NEPROQ6NW34 567 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 FBXO39Q8N4B4 442 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 CPXM1Q96SM3 734 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 BTBD7Q9P203 1132 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 COL1A2P08123 1366 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 CABYRO75952 493 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 ATP6V1B1P15313 513 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 PCID2Q5JVF3 399 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 CERS2Q96G23 380 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 CXorf56Q9H5V9 222 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 ACSS3Q9H6R3 686 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 TEKT2Q9UIF3 430 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 SLIT2O94813 1529 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 MEI4A8MW99 385 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 ITGB6P18564 788 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 CCDC15Q0P6D6 951 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 C9orf57Q5W0N0 161 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 SDE2Q6IQ49 451 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 OTOAQ7RTW8 1153 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 TMEM51Q9NW97 253 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 ALOX15BO15296 676 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 WEE1P30291 646 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 BAIAP3O94812 1187 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 SAR1AQ9NR31 198 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 SEPT3Q9UH03 358 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 ERCC2P18074 760 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 CD52P31358 61 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 PLK1P53350 603 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 MON1BQ7L1V2 547 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 UCMAQ8WVF2 138 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 NR6A1Q15406 480 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 UNC5AQ6ZN44 842 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 KCNK4Q9NYG8 393 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 DERAQ9Y315 318 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 RPL9P32969 192 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 ACOX2Q99424 681 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 DUSP16Q9BY84 665 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 ACTR8Q9H981 624 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 PCDH18Q9HCL0 1135 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 APPL1Q9UKG1 709 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 DAB1O75553 588 aa21.11■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 TOP6BLQ8N6T0 577 aa21.11■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 MID1IP1Q9NPA3 183 aa21.11■□□□□ 0.97
NISCH-201ENST00000345716 IPPQ9Y573 584 aa21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms