RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 CDC16Q13042 620 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 CCNIQ14094 377 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 KYAT1Q16773 422 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 EML3Q32P44 896 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF792Q3KQV3 632 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 DNAL1Q4LDG9 190 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 FBXO47Q5MNV8 452 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 CERCAMQ5T4B2 595 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 SLC27A1Q6PCB7 646 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 ISLR2Q6UXK2 745 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 STRA8Q7Z7C7 330 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 HPS6Q86YV9 775 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 MAPK15Q8TD08 544 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 SLC26A7Q8TE54 656 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 CDKL2Q92772 493 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 CERS2Q96G23 380 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 ECSITQ9BQ95 431 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 EBF3Q9H4W6 596 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 MROH8Q9H579 483 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 TXNDC16Q9P2K2 825 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 COPG2Q9UBF2 871 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 F8W8V4 182 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 NEMP1O14524 444 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 CXCL11O14625 94 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF195O14628 629 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 NRP1O14786 923 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 BUD23O43709 281 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 ZBTB14O43829 449 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 MMP3P08254 477 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 GNAT1P11488 350 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 ITGAXP20702 1163 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 COPAP53621 1224 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 MAP3K7CLP57077 242 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 AP2B1P63010 937 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 DEUP1Q05D60 604 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 ZBTB17Q13105 803 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 ITGA7Q13683 1181 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 LBRQ14739 615 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 SLC25A52Q3SY17 297 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 EFHC1Q5JVL4 640 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 C6orf163Q5TEZ5 329 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 KIAA0319Q5VV43 1072 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 FAM219BQ5XKK7 198 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 C4orf22Q6V702 233 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 FRMD7Q6ZUT3 714 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 STRADAQ7RTN6 431 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 UNC93AQ86WB7 457 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 NT5DC4Q86YG4 428 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 TTC39CQ8N584 583 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 NPWQ8N729 165 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 LRRC52Q8N7C0 313 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 ARRDC4Q8NCT1 418 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 OR6J1Q8NGC5 347 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 PPP4R1Q8TF05 950 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 APBB2Q92870 758 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 GATA6Q92908 595 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 MFSD3Q96ES6 412 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 KATNBL1Q9H079 304 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 SOX13Q9UN79 622 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 SSUH2Q9Y2M2 353 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 COL1A2P08123 1366 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 HACD1B0YJ81 288 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF487B1APH4 448 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 PIRO00625 290 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 OPHN1O60890 802 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 GPR32O75388 356 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 DAB1O75553 588 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 STK10O94804 968 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 POLBP06746 335 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 CHRNGP07510 517 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 MLNP12872 115 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 CPA3P15088 417 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 MPSTP25325 297 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 PTPN3P26045 913 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRR-202ENST00000342084 CNTFP26441 200 aa7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms