RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335523.7

VSTM2B-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VSTM2B, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2B-201ENST00000335523 NLRP14Q86W24 1093 aa20.09■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 LRRC49Q8IUZ0 686 aa20.09■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 ALLCQ8N6M5 410 aa20.09■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 ZSWIM3Q96MP5 696 aa20.09■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 OLFM3Q96PB7 478 aa20.09■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 ERP44Q9BS26 406 aa20.09■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 TMEM121Q9BTD3 319 aa20.09■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa20.09■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 KIF9Q9HAQ2 790 aa20.09■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 CLDND1Q9NY35 253 aa20.09■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 GDE1Q9NZC3 331 aa20.09■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 CLEC1BQ9P126 229 aa20.09■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 CLDN11O75508 207 aa20.08■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 CNTN5O94779 1100 aa20.08■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 MAPKAPK2P49137 400 aa20.08■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 NDST2P52849 883 aa20.08■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 CDH4P55283 916 aa20.08■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 GUCY2DQ02846 1103 aa20.08■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 ADGRE1Q14246 886 aa20.08■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 ALFQ53S48 1182 aa20.08■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 EP400NLQ6ZTU2 488 aa20.08■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM217AQ8IXS0 508 aa20.08■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa20.08■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 KIAA1958Q8N8K9 716 aa20.08■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC89Q8N998 374 aa20.08■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 CCNYQ8ND76 341 aa20.08■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 RIPOR3Q96MK2 946 aa20.08■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 EPC1Q9H2F5 836 aa20.08■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 EPB41L5Q9HCM4 733 aa20.08■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 TBC1D14Q9P2M4 693 aa20.08■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 CCL26Q9Y258 94 aa20.08■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
VSTM2B-201ENST00000335523 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 MAP3K6O95382 1288 aa20.07■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 KRT14P02533 472 aa20.07■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 FOSL2P15408 326 aa20.07■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 GALNT2Q10471 571 aa20.07■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 PTK6Q13882 451 aa20.07■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 CHST9Q7L1S5 443 aa20.07■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa20.07■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 CPXM2Q8N436 756 aa20.07■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 NPWQ8N729 165 aa20.07■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 MYLIPQ8WY64 445 aa20.07■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 PARD6BQ9BYG5 372 aa20.07■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 KLC2Q9H0B6 622 aa20.07■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 S1PR5Q9H228 398 aa20.07■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 TSPAN3O60637 253 aa20.06■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 IFNB1P01574 187 aa20.06■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 OR1E1P30953 314 aa20.06■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 ACTN2P35609 894 aa20.06■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 MTHFRP42898 656 aa20.06■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 DRG2P55039 364 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF33AQ06730 810 aa20.06■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 WDR93Q6P2C0 686 aa20.06■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 BBS7Q8IWZ6 715 aa20.06■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 NPAS3Q8IXF0 933 aa20.06■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 CFAP52Q8N1V2 620 aa20.06■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM71DQ8N9W8 422 aa20.06■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 FGF13Q92913 245 aa20.06■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 TRIM51Q9BSJ1 452 aa20.06■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 USP29Q9HBJ7 922 aa20.06■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 ASIC3Q9UHC3 531 aa20.06■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 DOCK6Q96HP0 2047 aa20.06■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 A0A1B0GVM2 712 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 TCAF2A6NFQ2 919 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 KCNN4O15554 427 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 MTSS1O43312 755 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 STK10O94804 968 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 PRAMEF12O95522 483 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 RBL1P28749 1068 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 GARSP41250 739 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 IRAK1P51617 712 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 RPS24P62847 133 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 AP1B1Q10567 949 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 COL19A1Q14993 1142 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 MPPE1Q53F39 396 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 AFMIDQ63HM1 303 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 DUPD1Q68J44 220 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC33Q8N5R6 958 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 SMARCD2Q92925 531 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 HDAC11Q96DB2 347 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.7 ms