RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 NDFIP2Q9NV92 336 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 MPP6Q9NZW5 540 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 MTRRQ9UBK8 725 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 SLC38A8A6NNN8 435 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 C1QAP02745 245 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 ATF6P18850 670 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 ITGB8P26012 769 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 CD68P34810 354 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 CDK16Q00536 496 aa18.35■□□□□ 0.53
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ACTB-201ENST00000331789 C10orf120Q5SQS8 335 aa18.35■□□□□ 0.53
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ACTB-201ENST00000331789 LRRC8BQ6P9F7 803 aa18.35■□□□□ 0.53
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ACTB-201ENST00000331789 C4orf33Q8N1A6 199 aa18.35■□□□□ 0.53
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ACTB-201ENST00000331789 SLC39A8Q9C0K1 460 aa18.35■□□□□ 0.53
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ACTB-201ENST00000331789 USP33Q8TEY7 942 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 MZB1Q8WU39 189 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 DPF3Q92784 378 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 TOP1MTQ969P6 601 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 CHMP6Q96FZ7 201 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 LTBP2Q14767 1821 aa18.34■□□□□ 0.53
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ACTB-201ENST00000331789 MGAT1P26572 445 aa18.33■□□□□ 0.53
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ACTB-201ENST00000331789 SLC44A1Q8WWI5 657 aa18.33■□□□□ 0.53
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ACTB-201ENST00000331789 FAM155BO75949 473 aa18.33■□□□□ 0.52
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ACTB-201ENST00000331789 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
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ACTB-201ENST00000331789 TAX1BP1Q86VP1 789 aa18.33■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 PPM1NQ8N819 430 aa18.33■□□□□ 0.52
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ACTB-201ENST00000331789 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa18.33■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 BACE2Q9Y5Z0 518 aa18.33■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 SLC12A8A0AV02 714 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 SEC24AO95486 1093 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 PRKCHP24723 683 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 MS4A13Q5J8X5 152 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 CTAGE3PQ8IX95 158 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 LRRC34Q8IZ02 419 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 ZNF683Q8IZ20 524 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 TEKT5Q96M29 485 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 GBA3Q9H227 469 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 C11orf49Q9H6J7 331 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 TRIM43BA6NCK2 446 aa18.31■□□□□ 0.52
ACTB-201ENST00000331789 FAM47DPA6NHR8 397 aa18.31■□□□□ 0.52
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