RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329151.5

TMEM54-201, Transcript of transmembrane protein 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM54, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54-201ENST00000329151 SLC2A3P11169 496 aa24.11■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 ABCB4P21439 1286 aa24.11■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 PSMD8P48556 350 aa24.11■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 RACK1P63244 317 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 MEA1Q16626 185 aa24.11■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 RABGAP1LQ5R372 815 aa24.11■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 DENND1BQ6P3S1 775 aa24.11■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 BEND5Q7L4P6 421 aa24.11■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 PROSER1Q86XN7 944 aa24.11■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 GALNT15Q8N3T1 639 aa24.11■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 STK32AQ8WU08 396 aa24.11■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 KREMEN1Q96MU8 473 aa24.11■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 PPP1R9BQ96SB3 815 aa24.11■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 THAP9Q9H5L6 903 aa24.11■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa24.11■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa24.11■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 E5RJQ4 531 aa24.1■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 ADH1BP00325 375 aa24.1■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 FYNP06241 537 aa24.1■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 TACR2P21452 398 aa24.1■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 SLC8A1P32418 973 aa24.1■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 OXCT1P55809 520 aa24.1■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 CDK17Q00537 523 aa24.1■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 MORC3Q14149 939 aa24.1■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 SLC45A4Q5BKX6 768 aa24.1■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 NCEH1Q6PIU2 408 aa24.1■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 LAYNQ6UX15 382 aa24.1■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa24.1■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 OR2T34Q8NGX1 318 aa24.1■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 SLC39A13Q96H72 371 aa24.1■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP24.1■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 FZD4Q9ULV1 537 aa24.1■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa24.1■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 PLXNA2O75051 1894 aa24.1■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa24.09■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa24.09■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 TTC34A8MYJ7 566 aa24.09■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 KCNK3O14649 394 aa24.09■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 TNFSF14O43557 240 aa24.09■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 C7P10643 843 aa24.09■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 GALCP54803 685 aa24.09■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 SNX16P57768 344 aa24.09■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 SULT2A1Q06520 285 aa24.09■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 SLC12A1Q13621 1099 aa24.09■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 FSCBQ5H9T9 825 aa24.09■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 SYPL2Q5VXT5 272 aa24.09■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF606Q8WXB4 792 aa24.09■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 NOX5Q96PH1 765 aa24.09■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 SLC4A5Q9BY07 1137 aa24.09■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 COX16Q9P0S2 106 aa24.09■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 FTSJ1Q9UET6 329 aa24.09■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa24.09■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 A0A1W2PPC4 97 aa24.08■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 H0Y8X5 98 aa24.08■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 PCDHGA12O60330 932 aa24.08■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 IL1BP01584 269 aa24.08■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 RPL34P49207 117 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 MARSP56192 900 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 IL9RQ01113 521 aa24.08■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 ARID5BQ14865 1188 aa24.08■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 ARHGAP44Q17R89 818 aa24.08■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 DSG4Q86SJ6 1040 aa24.08■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 OR14C36Q8NHC7 312 aa24.08■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 MYO19Q96H55 970 aa24.08■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 LMLNQ96KR4 655 aa24.08■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 MRGPRX3Q96LB0 322 aa24.08■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 NEUROG2Q9H2A3 272 aa24.08■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 CNTN6Q9UQ52 1028 aa24.08■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 BTBD3Q9Y2F9 522 aa24.08■■□□□ 1.45
TMEM54-201ENST00000329151 VILLO15195 856 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM54-201ENST00000329151 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
TMEM54-201ENST00000329151 IGHV4-34P06331 123 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM54-201ENST00000329151 C5AR1P21730 350 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM54-201ENST00000329151 CTSKP43235 329 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM54-201ENST00000329151 PDCLQ13371 301 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM54-201ENST00000329151 C9orf64Q5T6V5 341 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM54-201ENST00000329151 DBX2Q6ZNG2 339 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM54-201ENST00000329151 MYEOVQ96EZ4 313 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM54-201ENST00000329151 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
TMEM54-201ENST00000329151 SLC6A18Q96N87 628 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM54-201ENST00000329151 CRACR2AQ9BSW2 395 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM54-201ENST00000329151 SYNCQ9H7C4 482 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM54-201ENST00000329151 DDIT4Q9NX09 232 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM54-201ENST00000329151 SLC25A13Q9UJS0 675 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM54-201ENST00000329151 KCNU1A8MYU2 1149 aa24.06■■□□□ 1.44
TMEM54-201ENST00000329151 PDGFRAP16234 1089 aa24.06■■□□□ 1.44
TMEM54-201ENST00000329151 GOT1P17174 413 aa24.06■■□□□ 1.44
TMEM54-201ENST00000329151 BMP6P22004 513 aa24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms