RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323081.12

SPNS1-202, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPNS1, Length 2,102 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-202ENST00000323081 BHLHA9Q7RTU4 235 aa18.07■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 NPWQ8N729 165 aa18.07■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 OR52K1Q8NGK4 314 aa18.07■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 WDCPQ9H6R7 721 aa18.07■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 ARL8BQ9NVJ2 186 aa18.07■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 SNX10Q9Y5X0 201 aa18.07■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 PSAT1Q9Y617 370 aa18.07■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 TPP1O14773 563 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 NCAM2O15394 837 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 CA12O43570 354 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 POMCP01189 267 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 POLBP06746 335 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 FCGRTP55899 365 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 OCRLQ01968 901 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 TEX44Q53QW1 395 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 RASSF3Q86WH2 238 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 MYLPFQ96A32 169 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF570Q96NI8 536 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 RAD54BQ9Y620 910 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa18.06■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 BIRC5O15392 142 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF623O75123 536 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 USP12O75317 370 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 F9P00740 461 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 ERVK-10P10266 1014 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 CAP1Q01518 475 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 PRKCZQ05513 592 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 CD300LGQ6UXG3 332 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 FAM13CQ8NE31 585 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 ACMSDQ8TDX5 336 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 PGLYRP2Q96PD5 576 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 GORASP1Q9BQQ3 440 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 TUBB6Q9BUF5 446 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 TKTL2Q9H0I9 626 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 RRN3Q9NYV6 651 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 ZFATQ9P243 1243 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 TXNDC16Q9P2K2 825 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 B3GAT3O94766 335 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 ITGA2BP08514 1039 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 KITP10721 976 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 BRCC3P46736 316 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 PDE1BQ01064 536 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 NAB1Q13506 487 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 KCNA10Q16322 511 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 C16orf46Q6P387 395 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 NSL1Q96IY1 281 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 KCNK4Q9NYG8 393 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 OR12D3Q9UGF7 316 aa18.05■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 CCDC22O60826 627 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 AP2A1O95782 977 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 ODC1P11926 461 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 BDNFP23560 247 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 TM4SF4P48230 202 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 DSC3Q14574 896 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 LPIN1Q14693 890 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 TTC7BQ86TV6 843 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 CRLF3Q8IUI8 442 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 DNAAF3Q8N9W5 541 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 CERS2Q96G23 380 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 EPAS1Q99814 870 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 C20orf27Q9GZN8 174 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 A0A0U1RQF3 1178 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 FCHO1O14526 889 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 SNNO75324 88 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 MX2P20592 715 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 CXCR3P49682 368 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 STX3Q13277 289 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 SPANXN3Q5MJ09 141 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 HASPINQ8TF76 798 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 ATP2A3Q93084 1043 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 RNF34Q969K3 372 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 MIPEPQ99797 713 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 BRD8Q9H0E9 1235 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa18.04■□□□□ 0.48
SPNS1-202ENST00000323081 BFARQ9NZS9 450 aa18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.5 ms