RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 CCHCR1Q8TD31 782 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 BRD8Q9H0E9 1235 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 TDP1Q9NUW8 608 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 TNFRSF8P28908 595 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 VSNL1P62760 191 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 GALNT2Q10471 571 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 ALFQ53S48 1182 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 SYCE2Q6PIF2 218 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 ITFG1Q8TB96 612 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 SH3RF2Q8TEC5 729 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 ING5Q8WYH8 240 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF212Q9UDV6 495 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 MTCH2Q9Y6C9 303 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 E2F8A0AVK6 867 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 CNTN5O94779 1100 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 KRT14P02533 472 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 TCF3P15923 654 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 WEE1P30291 646 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 MAPKAPK2P49137 400 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 DRG2P55039 364 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 GRIN2CQ14957 1233 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 AFMIDQ63HM1 303 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 HDAC11Q96DB2 347 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 RTP4Q96DX8 246 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 MYEOVQ96EZ4 313 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 HINFPQ9BQA5 517 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 C10orf88Q9H8K7 445 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 USP29Q9HBJ7 922 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 ASIC3Q9UHC3 531 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 CCL26Q9Y258 94 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 ESYT3A0FGR9 886 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 IFNB1P01574 187 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 FSHRP23945 695 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 RBL1P28749 1068 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 GARSP41250 739 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 NDST2P52849 883 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 GDF10P55107 478 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 CUL1Q13616 776 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 TP53INP2Q8IXH6 220 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 FAM71DQ8N9W8 422 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 LGMNQ99538 433 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 FERMT1Q9BQL6 677 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 TRIM31Q9BZY9 425 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 FAM114A2Q9NRY5 505 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 NDFIP2Q9NV92 336 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 GFRA2O00451 464 aa20.22■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 KCNN4O15554 427 aa20.22■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 PRAMEF12O95522 483 aa20.22■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 CDH4P55283 916 aa20.22■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF33AQ06730 810 aa20.22■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa20.22■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 CHST9Q7L1S5 443 aa20.22■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 LRRC49Q8IUZ0 686 aa20.22■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 CPXM2Q8N436 756 aa20.22■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC33Q8N5R6 958 aa20.22■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 CCNYQ8ND76 341 aa20.22■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 ZSWIM3Q96MP5 696 aa20.22■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 APOL5Q9BWW9 433 aa20.22■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 DPH5Q9H2P9 285 aa20.22■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 KIF9Q9HAQ2 790 aa20.22■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 A0A1B0GVM2 712 aa20.21■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 TCAF2A6NFQ2 919 aa20.21■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 CLDN11O75508 207 aa20.21■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 CHKAP35790 457 aa20.21■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 RPS24P62847 133 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 USP4Q13107 963 aa20.21■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.21■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 BBS7Q8IWZ6 715 aa20.21■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 CFAP52Q8N1V2 620 aa20.21■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 GLIS1Q8NBF1 620 aa20.21■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 NETO2Q8NC67 525 aa20.21■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 TTC16Q8NEE8 873 aa20.21■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 HTR3CQ8WXA8 447 aa20.21■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 ADAM7Q9H2U9 754 aa20.21■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 CLEC1BQ9P126 229 aa20.21■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 SHROOM3Q8TF72 1996 aa20.21■□□□□ 0.83
CCDC71-201ENST00000321895 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms