RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 GKN1Q9NS71 199 aa16.77■□□□□ 0.28
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CHTF18-202ENST00000317063 ZNF510Q9Y2H8 683 aa16.75■□□□□ 0.27
CHTF18-202ENST00000317063 KCNU1A8MYU2 1149 aa16.74■□□□□ 0.27
CHTF18-202ENST00000317063 KCNN4O15554 427 aa16.74■□□□□ 0.27
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CHTF18-202ENST00000317063 RFPL2O75678 378 aa16.74■□□□□ 0.27
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CHTF18-202ENST00000317063 BLMHQ13867 455 aa16.74■□□□□ 0.27
CHTF18-202ENST00000317063 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF697Q5TEC3 545 aa16.74■□□□□ 0.27
CHTF18-202ENST00000317063 PIK3R6Q5UE93 754 aa16.74■□□□□ 0.27
CHTF18-202ENST00000317063 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CHTF18-202ENST00000317063 C16orf87Q6PH81 154 aa16.74■□□□□ 0.27
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