RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.05■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa22.05■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 RGS18Q9NS28 235 aa22.05■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 STOML1Q9UBI4 398 aa22.05■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 LRCH1Q9Y2L9 728 aa22.05■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 STK10O94804 968 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 INHBAP08476 426 aa22.04■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 HOXD10P28358 340 aa22.04■■□□□ 1.12
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MESP1-201ENST00000300057 POLE2P56282 527 aa22.04■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 SLC1A5Q15758 541 aa22.04■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 ARL13BQ3SXY8 428 aa22.04■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 RNF220Q5VTB9 566 aa22.04■■□□□ 1.12
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MESP1-201ENST00000300057 LONP2Q86WA8 852 aa22.04■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 WDCPQ9H6R7 721 aa22.04■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 SQORQ9Y6N5 450 aa22.04■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
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MESP1-201ENST00000300057 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.04■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 SLC44A1Q8WWI5 657 aa22.04■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.04■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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MESP1-201ENST00000300057 LRRC37BQ96QE4 947 aa22.04■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 TKTL2Q9H0I9 626 aa22.04■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 PLAC1Q9HBJ0 212 aa22.04■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 GRID1Q9ULK0 1009 aa22.04■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 TAC1P20366 129 aa22.03■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 MAGEA3P43357 314 aa22.03■■□□□ 1.12
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MESP1-201ENST00000300057 SEMA3BQ13214 749 aa22.03■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 CLLU1OSQ5K130 101 aa22.03■■□□□ 1.12
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MESP1-201ENST00000300057 PPM1NQ8N819 430 aa22.03■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 IRGQQ8WZA9 623 aa22.03■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 RNF34Q969K3 372 aa22.03■■□□□ 1.12
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MESP1-201ENST00000300057 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.03■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 MOXD2PA6NHM9 499 aa22.03■■□□□ 1.12
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MESP1-201ENST00000300057 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.03■■□□□ 1.12
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MESP1-201ENST00000300057 A0A1W2PQY0 241 aa22.02■■□□□ 1.12
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MESP1-201ENST00000300057 SLC18A1P54219 525 aa22.02■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 CBLBQ13191 982 aa22.02■■□□□ 1.12
MESP1-201ENST00000300057 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
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MESP1-201ENST00000300057 LRRC39Q96DD0 335 aa22.02■■□□□ 1.12
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MESP1-201ENST00000300057 MT-ND3P03897 115 aa22.02■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 TARSP26639 723 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
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MESP1-201ENST00000300057 PCDHB8Q9UN66 801 aa22.02■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 NLRC5Q86WI3 1866 aa22.01■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
MESP1-201ENST00000300057 APOEP02649 317 aa22.01■■□□□ 1.11
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