RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 AGAP3Q96P47 875 aa23.35■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 MPP6Q9NZW5 540 aa23.35■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PPM1 405 aa23.35■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 C1QAP02745 245 aa23.35■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 DEFB103AP81534 67 aa23.35■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa23.35■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa23.35■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 SLC38A8A6NNN8 435 aa23.34■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 FAM107AO95990 144 aa23.34■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 CD68P34810 354 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 SPARCL1Q14515 664 aa23.34■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA1841Q6NSI8 718 aa23.34■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 UNC5AQ6ZN44 842 aa23.34■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 DPF3Q92784 378 aa23.34■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 TRABDQ9H4I3 376 aa23.34■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 SPAG7O75391 227 aa23.34■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 HTR7P34969 479 aa23.34■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 GJA8P48165 433 aa23.34■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 OLIG2Q13516 323 aa23.34■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 TEX44Q53QW1 395 aa23.34■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 C10orf120Q5SQS8 335 aa23.34■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC8BQ6P9F7 803 aa23.34■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 C4orf33Q8N1A6 199 aa23.34■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 MTSS1O43312 755 aa23.33■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 SLC2A3P11169 496 aa23.33■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 MLNP12872 115 aa23.33■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 CSF2RAP15509 400 aa23.33■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 STX2P32856 288 aa23.33■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 RFC2P35250 354 aa23.33■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 PSEN1P49768 467 aa23.33■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 CRADDP78560 199 aa23.33■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 C1orf74Q96LT6 269 aa23.33■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 SLC39A8Q9C0K1 460 aa23.33■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 C11orf49Q9H6J7 331 aa23.33■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 CCSER2Q9H7U1 834 aa23.33■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 MARCH2Q9P0N8 246 aa23.33■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 RSPH14Q9UHP6 348 aa23.33■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 VANGL2Q9ULK5 521 aa23.33■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 BACE2Q9Y5Z0 518 aa23.33■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
VSTM4-201ENST00000298454 JCHAINP01591 159 aa23.33■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 HMBSP08397 361 aa23.33■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 CLSTN3Q9BQT9 956 aa23.33■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 NUP205Q92621 2012 aa23.32■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa23.32■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM43BA6NCK2 446 aa23.32■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 APOEP02649 317 aa23.32■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 QPCTQ16769 361 aa23.32■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 MS4A13Q5J8X5 152 aa23.32■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 MZB1Q8WU39 189 aa23.32■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 SLC44A1Q8WWI5 657 aa23.32■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 GBA3Q9H227 469 aa23.32■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 COMMD8Q9NX08 183 aa23.32■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 TRHDEQ9UKU6 1024 aa23.32■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 SLC12A8A0AV02 714 aa23.31■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa23.31■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 NFKB1P19838 968 aa23.31■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 MGAT1P26572 445 aa23.31■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
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VSTM4-201ENST00000298454 USP33Q8TEY7 942 aa23.31■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 DYDC1Q8WWB3 177 aa23.31■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 CHMP6Q96FZ7 201 aa23.31■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 SMC6Q96SB8 1091 aa23.31■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 SMYD2Q9NRG4 433 aa23.31■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 PRKCHP24723 683 aa23.31■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 COG7P83436 770 aa23.31■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 CASC4Q6P4E1 433 aa23.31■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 TAX1BP1Q86VP1 789 aa23.31■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 CTAGE3PQ8IX95 158 aa23.31■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF683Q8IZ20 524 aa23.31■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 ATPAF2Q8N5M1 289 aa23.31■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 LZTR1Q8N653 840 aa23.31■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa23.31■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 TEKT5Q96M29 485 aa23.31■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 VAT1Q99536 393 aa23.31■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC134Q9H6E4 229 aa23.31■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 SENP1Q9P0U3 644 aa23.31■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa23.31■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 GREB1Q4ZG55 1949 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 SDR42E2A6NKP2 422 aa23.3■■□□□ 1.32
VSTM4-201ENST00000298454 TLR5O60602 858 aa23.3■■□□□ 1.32
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