RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 GALCP54803 685 aa20.28■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 ECT2LQ008S8 904 aa20.28■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 GJB7Q6PEY0 223 aa20.28■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 TRIM65Q6PJ69 517 aa20.28■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 APCDD1Q8J025 514 aa20.28■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 IGSF8Q969P0 613 aa20.28■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 CDC6Q99741 560 aa20.28■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 CRACR2AQ9BSW2 395 aa20.28■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa20.28■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 BTBD3Q9Y2F9 522 aa20.28■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa20.27■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 A0A1W2PP55 124 aa20.27■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 TAF4O00268 1085 aa20.27■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 CAPNS1P04632 268 aa20.27■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 USP8P40818 1118 aa20.27■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 SCAPQ12770 1279 aa20.27■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 PDCLQ13371 301 aa20.27■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 TAF5Q15542 800 aa20.27■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 ARHGAP44Q17R89 818 aa20.27■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 KCNT1Q5JUK3 1230 aa20.27■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 CREBRFQ8IUR6 639 aa20.27■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa20.27■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 OMDQ99983 421 aa20.27■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 NEUROG2Q9H2A3 272 aa20.27■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 TOR4AQ9NXH8 423 aa20.27■□□□□ 0.84
CXCL3-201ENST00000296026 ITIH6Q6UXX5 1313 aa20.27■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 A0A1W2PPC4 97 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 BECN2A8MW95 431 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 KCNU1A8MYU2 1149 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 F5H5T6 163 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 H0Y8X5 98 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 SLC9A1P19634 815 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 SLC8A1P32418 973 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 CTSKP43235 329 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 CCT8P50990 548 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 RACK1P63244 317 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 NCEH1Q6PIU2 408 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 PROSER1Q86XN7 944 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 FAM81BQ96LP2 452 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 FAM129BQ96TA1 746 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 FZD4Q9ULV1 537 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 PLXNA2O75051 1894 aa20.26■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 LRRC72A6NJI9 287 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 GOLGA8CPA6NN73 597 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 PSMD8P48556 350 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 NUMBP49757 651 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 STK19P49842 368 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 CDK17Q00537 523 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 APBA1Q02410 837 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 DEFB106AQ8N104 65 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 STK40Q8N2I9 435 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 OR2T34Q8NGX1 318 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 PTPRN2Q92932 1015 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 SLC6A18Q96N87 628 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 FAM204AQ9H8W3 233 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 APEX2Q9UBZ4 518 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 RWDD2AQ9UIY3 292 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa20.25■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 ZZEF1O43149 2961 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 VILLO15195 856 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 PCDHGA12O60330 932 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 DKK1O94907 266 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 SLC2A3P11169 496 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 PDGFRAP16234 1089 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 ABCB4P21439 1286 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 NNMTP40261 264 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 GRK6P43250 576 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 C21orf59P57076 290 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 IL9RQ01113 521 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 SLC12A1Q13621 1099 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 GBP6Q6ZN66 633 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 WDTC1Q8N5D0 677 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 AADATQ8N5Z0 425 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 RNF34Q969K3 372 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 CPXM1Q96SM3 734 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 EBF2Q9HAK2 575 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 DDIT4Q9NX09 232 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 COX16Q9P0S2 106 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 PTPRBP23467 1997 aa20.24■□□□□ 0.83
CXCL3-201ENST00000296026 ASPMQ8IZT6 3477 aa20.23■□□□□ 0.83
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