RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 H0Y626 953 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 M0R296 226 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 TRIM24O15164 1050 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 CREB3O43889 395 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 PALMO75781 387 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 KAT7O95251 611 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 APODP05090 189 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 CD72P21854 359 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 TARSP26639 723 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 EPHB2P29323 1055 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 GRIA2P42262 883 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 MAPKAPK2P49137 400 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 CDH6P55285 790 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 OXCT1P55809 520 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 TPI1P60174 286 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 MESP2Q0VG99 397 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 CCINQ13939 588 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 PDK2Q15119 407 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 FSTL4Q6MZW2 842 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 NT5DC3Q86UY8 548 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 VSIG1Q86XK7 387 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 REXO1L1PQ8IX06 675 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 CARNMT1Q8N4J0 409 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 PYCARDQ9ULZ3 195 aa13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF487B1APH4 448 aa13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 H3BRJ5 948 aa13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 GOT1P17174 413 aa13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 CTNNA2P26232 953 aa13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 GJC1P36383 396 aa13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 ARL4AP40617 200 aa13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 PLK1P53350 603 aa13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 KDSRQ06136 332 aa13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 LMAN2Q12907 356 aa13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 SLC12A1Q13621 1099 aa13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 DPYSQ14117 519 aa13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 DPYSL3Q14195 570 aa13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 FSCBQ5H9T9 825 aa13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 RFX8Q6ZV50 586 aa13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 NUDT18Q6ZVK8 323 aa13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 PJA1Q8NG27 643 aa13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 FAF2Q96CS3 445 aa13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF670Q9BS34 389 aa13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 EPHX3Q9H6B9 360 aa13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 DONSONQ9NYP3 566 aa13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 GGA2Q9UJY4 613 aa13.61□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC66A2RUB6 948 aa13.6□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 EGFP01133 1207 aa13.6□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 CD48P09326 243 aa13.6□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 CHRNB1P11230 501 aa13.6□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 KDELR1P24390 212 aa13.6□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 IL4RP24394 825 aa13.6□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 OR1E1P30953 314 aa13.6□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 CD70P32970 193 aa13.6□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 TNFRSF4P43489 277 aa13.6□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 FZD5Q13467 585 aa13.6□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 KRT81Q14533 505 aa13.6□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 DMC1Q14565 340 aa13.6□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 GEN1Q17RS7 908 aa13.6□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 FBXO43Q4G163 708 aa13.6□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 DGKKQ5KSL6 1271 aa13.6□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 C6orf118Q5T5N4 469 aa13.6□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF783Q6ZMS7 281 aa13.6□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 PEX26Q7Z412 305 aa13.6□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa13.6□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 MAP7D3Q8IWC1 876 aa13.6□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC105Q8IYK2 499 aa13.6□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 KATNAL2Q8IYT4 538 aa13.6□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 AHI1Q8N157 1196 aa13.6□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 SYNPOQ8N3V7 929 aa13.6□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 KCTD6Q8NC69 237 aa13.6□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 OR52K2Q8NGK3 314 aa13.6□□□□□ -0.23
CCDC42-201ENST00000293845 RAPGEF5Q92565 580 aa13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms