RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 FOXR1Q6PIV2 292 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 FAM192AQ9GZU8 254 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D12O60347 775 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 PSMG1O95456 288 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 BMP6P22004 513 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 CYP3A7P24462 503 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 DDR2Q16832 855 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 RNF43Q68DV7 783 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 UNC93AQ86WB7 457 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC19Q96DA6 116 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 IL22Q9GZX6 179 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ATP13A1Q9HD20 1204 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 GSTM1P09488 218 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 APOL4Q9BPW4 351 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 PIF1Q9H611 641 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL28Q9NXS3 571 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 PSMD10O75832 226 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 MYL4P12829 197 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 PIK3CGP48736 1102 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 CES3Q6UWW8 571 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 NECAB2Q7Z6G3 386 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 DHRSXQ8N5I4 330 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ELMO3Q96BJ8 720 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ROGDIQ9GZN7 287 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL3Q9UH77 587 aa21.54■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 PEX1O43933 1283 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 UNC5CO95185 931 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ATG7O95352 703 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 PIGNO95427 931 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 AKAP5P24588 427 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 CENPAP49450 140 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 BAP1Q92560 729 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 KAT5Q92993 513 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 TAS2R14Q9NYV8 317 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0A0MRY4 1105 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 LIASO43766 372 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 NPM3O75607 178 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 GJB6O95452 261 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 LTFP02788 710 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 C4BPBP20851 252 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 CASP5P51878 434 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 CHMP1BQ7LBR1 199 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA13Q96N96 652 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 CDHR5Q9HBB8 845 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC167Q9P0B6 97 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 TPRKBQ9Y3C4 175 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 PXDNQ92626 1479 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 TGFB2P61812 414 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 C10orf53Q8N6V4 93 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 A0A087WXM4 84 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 NOS2P35228 1153 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 TALDO1P37837 337 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ITIH5Q86UX2 942 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ACTRT2Q8TDY3 377 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJB3Q8WWF6 145 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 HAS1Q92839 578 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 RNF145Q96MT1 663 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 POMKQ9H5K3 350 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 NFASCO94856 1347 aa21.53■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 HSMCR30P0CW71 290 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 CYP2C18P33260 490 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 MILR1Q7Z6M3 343 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 STK32CQ86UX6 486 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM86AQ8N2M4 240 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 SPPL2AQ8TCT8 520 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ASTN1O14525 1302 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 DCDC2CA8MYV0 355 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 FAM20BO75063 409 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ANGPT1Q15389 498 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 RNF148Q8N7C7 305 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ARRDC4Q8NCT1 418 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 STK39Q9UEW8 545 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 LIMD1Q9UGP4 676 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL20Q9Y2M5 609 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 DLG4P78352 724 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 EXOC3L1Q86VI1 746 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 SHC3Q92529 594 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 ART4Q93070 314 aa21.52■■□□□ 1.04
CCSAP-201ENST00000284617 WNT8BQ93098 351 aa21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms