RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258014.3

PKIB-201, Transcript of cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PKIB, Length 1,595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKIB-201ENST00000258014 SP1P08047 785 aa3.54□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 BDNFP23560 247 aa3.54□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 RAB27AP51159 221 aa3.54□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 DMWDQ09019 674 aa3.54□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 TRAF2Q12933 501 aa3.54□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 GALEQ14376 348 aa3.54□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 KCNAB1Q14722 419 aa3.54□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 CREB3L2Q70SY1 520 aa3.54□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 EXOC6Q8TAG9 804 aa3.54□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 TTC8Q8TAM2 541 aa3.54□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 RTP4Q96DX8 246 aa3.54□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 DUX5Q96PT3 197 aa3.54□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 SELENOOQ9BVL4 669 aa3.54□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 SPRY4Q9C004 299 aa3.54□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 MAP6D1Q9H9H5 199 aa3.54□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 SPAG4Q9NPE6 437 aa3.54□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 IP6K2Q9UHH9 426 aa3.54□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 HPSEQ9Y251 543 aa3.54□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa3.54□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 CCDC7Q96M83 1385 aa3.54□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 BECN2A8MW95 431 aa3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 DYNC1I1O14576 645 aa3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 ARSBP15848 533 aa3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 HSPA6P17066 643 aa3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 BTF3P20290 206 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 TAF6P49848 677 aa3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 PDLIM4P50479 330 aa3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 CLCN5P51795 746 aa3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 HMBOX1Q6NT76 420 aa3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 SUN3Q8TAQ9 357 aa3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 FAM227BQ96M60 508 aa3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 GRPEL1Q9HAV7 217 aa3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 PTPRHQ9HD43 1115 aa3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 TCF7L2Q9NQB0 619 aa3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 TBC1D14Q9P2M4 693 aa3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 CPNE7Q9UBL6 633 aa3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 CAPN11Q9UMQ6 739 aa3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 AK9Q5TCS8 1911 aa3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 UACAQ9BZF9 1416 aa3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa3.53□□□□□ -1.84
PKIB-201ENST00000258014 UQCRHLA0A096LP55 91 aa3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 PLSCR5A0PG75 271 aa3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 PRR23AA6NEV1 266 aa3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 VGLL3A8MV65 326 aa3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 IGLV2-11P01706 119 aa3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 UQCRHP07919 91 aa3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 MMP8P22894 467 aa3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 YY1P25490 414 aa3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 SERPINB3P29508 390 aa3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 NEK2P51955 445 aa3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 ABATP80404 500 aa3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 FMO1Q01740 532 aa3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 SLC20A2Q08357 652 aa3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 GPR18Q14330 331 aa3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 BECN1Q14457 450 aa3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 PPP2R5AQ15172 486 aa3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 ERAP2Q6P179 960 aa3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 DSTYKQ6XUX3 929 aa3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 MAEAQ7L5Y9 396 aa3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 PPP1R35Q8TAP8 253 aa3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 ASB12Q8WXK4 309 aa3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 CHST8Q9H2A9 424 aa3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 RXFP3Q9NSD7 469 aa3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 SLC8A2Q9UPR5 921 aa3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 USP19O94966 1318 aa3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 KDM5CP41229 1560 aa3.52□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 SH3BP5O60239 455 aa3.51□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 LCATP04180 440 aa3.51□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 BRAFP15056 766 aa3.51□□□□□ -1.85
PKIB-201ENST00000258014 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms