RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640634.1

SCARB2-222, Transcript of scavenger receptor class B member 2, human

TSL 5

Gene SCARB2, Length 1,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCARB2-222	ENST00000640634	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC11A2	P49281	568 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	FBXL22	Q6P050	247 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	STRADA	Q7RTN6	431 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	FLCN	Q8NFG4	579 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	TSC1	Q92574	1164 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	RRN3	Q9NYV6	651 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	TBL1X	O60907	577 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	TULP3	O75386	442 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	CNTN5	O94779	1100 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	ADH1C	P00326	375 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	ALAD	P13716	330 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	MIP	P30301	263 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	HOXC13	P31276	330 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	GALK1	P51570	392 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	SPA17	Q15506	151 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	CPXM2	Q8N436	756 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	DDI1	Q8WTU0	396 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	OTUB2	Q96DC9	234 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	NEU3	Q9UQ49	428 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	CCDC189	A1A4V9	331 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	BUB1	O43683	1085 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	SRGAP2	O75044	1071 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	F9	P00740	461 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	EGF	P01133	1207 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	GLUL	P15104	373 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	ADRA1B	P35368	520 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	GJC1	P36383	396 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	TAS2R40	P59535	323 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	MESD	Q14696	234 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	ALF	Q53S48	1182 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	FSCB	Q5H9T9	825 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634		Q6ZS52	159 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	PLPP6	Q8IY26	295 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	RFFL	Q8WZ73	363 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	FAM3C	Q92520	227 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	MPP6	Q9NZW5	540 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	MARK1	Q9P0L2	795 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	CACNG3	O60359	315 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	ICMT	O60725	284 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	LATS1	O95835	1130 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC2A3	P11169	496 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	CHKA	P35790	457 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	STARD6	P59095	220 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	GAD2	Q05329	585 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	FZD5	Q13467	585 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	AZIN2	Q96A70	460 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	ZWILCH	Q9H900	591 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	FZD10	Q9ULW2	581 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	PRRT4	C9JH25	899 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634		E9PAM4	449 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634		F5H5T6	163 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	MYO1F	O00160	1098 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	PROSC	O94903	275 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SCARB2-222	ENST00000640634	CISD3	P0C7P0	127 aa		11.29	□□□□□ -0.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms