RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 OVGP1Q12889 678 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PPM1LQ5SGD2 360 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 WSCD1Q658N2 575 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 LBX2Q6XYB7 198 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 DTX3LQ8TDB6 740 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 STARD8Q92502 1023 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 MBOAT7Q96N66 472 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 DUSP16Q9BY84 665 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CHST7Q9NS84 486 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SCN3BQ9NY72 215 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TAS2R13Q9NYV9 303 aa6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 C5P01031 1676 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM114B3SHH9 223 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 NUDT17P0C025 328 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 FAM153BP0C7A2 387 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 MSH3P20585 1137 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 KLRC2P26717 231 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 RBL1P28749 1068 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CCNG1P51959 295 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TGM3Q08188 693 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CSHL1Q14406 222 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 FAM153CQ494X1 144 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 BRMS1LQ5PSV4 323 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 C9orf57Q5W0N0 161 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PGBD3Q8N328 593 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TERB1Q8NA31 727 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 RFWD2Q8NHY2 731 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PANX3Q96QZ0 392 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PLA2G4CQ9UP65 541 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 FKBP9O95302 570 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 MAP3K6O95382 1288 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 IFNA14P01570 189 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 MYL4P12829 197 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SERPINB5P36952 375 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SCNN1BP51168 640 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SCNN1GP51170 649 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SP3Q02447 781 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 GRAMD4Q6IC98 578 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 BBS12Q6ZW61 710 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 DEFB128Q7Z7B8 93 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 DSG4Q86SJ6 1040 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 RDH11Q8TC12 318 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ACMSDQ8TDX5 336 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 GAD1Q99259 594 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 RGS18Q9NS28 235 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SPG21Q9NZD8 308 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 FZD1Q9UP38 647 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SORCS3Q9UPU3 1222 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PKD1L3Q7Z443 1732 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 OR6C75A6NL08 312 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM13O60858 407 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM16O95361 564 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TRIP10Q15642 601 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 DNAAF5Q86Y56 855 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 KIF2BQ8N4N8 673 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TCP10LQ8TDR4 215 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 MYLPFQ96A32 169 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CNGB3Q9NQW8 809 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 MPP6Q9NZW5 540 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 GGA2Q9UJY4 613 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PARNO95453 639 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 RPN2P04844 631 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 KCNA3P22001 575 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 KCNA4P22459 653 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SOAT1P35610 550 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 GRK3P35626 688 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 MATKP42679 507 aa6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 EVX2Q03828 476 aa6.6□□□□□ -1.35
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