RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 MPP7Q5T2T1 576 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 UNC45BQ8IWX7 931 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 SAP25Q8TEE9 199 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 BAP1Q92560 729 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 ASLP04424 464 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMD8P48556 350 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 ACADVLP49748 655 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC45A4Q5BKX6 768 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 NUGGCQ68CJ6 796 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 ATL3Q6DD88 541 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 CARNMT1Q8N4J0 409 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 EEF2KMTQ96G04 330 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 PRORYQ9H606 182 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 EBF2Q9HAK2 575 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP83Q9Y592 693 aa28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 TK2O00142 265 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 IRAK2O43187 625 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 ACSL4O60488 711 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR29P0C7W0 189 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC6A4P31645 630 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 SHBQ15464 509 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC17Q96AE7 1141 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 MYO19Q96H55 970 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 SERAC1Q96JX3 654 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 CNGB3Q9NQW8 809 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 RAI2Q9Y5P3 530 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 RHOBTB3O94955 611 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 SETSIPP0DME0 302 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 EPB41P11171 864 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC8A1P32418 973 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 RGS7P49802 495 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 TBX4P57082 545 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 DAOAP59103 153 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 CDH18Q13634 790 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 TCERG1LQ5VWI1 586 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 OR14C36Q8NHC7 312 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 FZD4Q9ULV1 537 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-217ENST00000629983 PIK3R2O00459 728 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 CUL2Q13617 745 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 MSANTD2Q6P1R3 559 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 FIBINQ8TAL6 211 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 COL26A1Q96A83 441 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 NRSN2Q9GZP1 204 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 RCOR1Q9UKL0 485 aa28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PR77 199 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC34A8MYJ7 566 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 WNT9AO14904 365 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 C1QL1O75973 258 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 CCR5P51681 352 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNJ12Q14500 433 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 C9orf64Q5T6V5 341 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.137e-7■■□□□ 11.5
CAPNS1-217ENST00000629983 KCTD13Q8WZ19 329 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 MRGPRX3Q96LB0 322 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 ERVW-1Q9UQF0 538 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 MOCS3O95396 460 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 VDRP11473 427 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 SYKP43405 635 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 NXPH1P58417 271 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS24P62847 133 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 BNIP3Q12983 259 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 PITRM1Q5JRX3 1037 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXL19Q6PCT2 694 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 OXR1Q8N573 874 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 TLR4O00206 839 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 O00370 1275 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 CAPN9O14815 690 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 CETN3O15182 167 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV3-27P01718 113 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 CMA1P23946 247 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 RTP5Q14D33 572 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 NADSYN1Q6IA69 706 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 LMLNQ96KR4 655 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa28.34■■■□□ 2.13
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