RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		7.46	□□□□□ -1.21
LETMD1-238	ENST00000623495	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		7.46	□□□□□ -1.21
LETMD1-238	ENST00000623495	TTC39C	Q8N584	583 aa		7.46	□□□□□ -1.21
LETMD1-238	ENST00000623495	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		7.46	□□□□□ -1.21
LETMD1-238	ENST00000623495	UCMA	Q8WVF2	138 aa		7.46	□□□□□ -1.21
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRC45	Q96CN5	670 aa		7.46	□□□□□ -1.21
LETMD1-238	ENST00000623495	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.21
LETMD1-238	ENST00000623495	CCT7	Q99832	543 aa		7.46	□□□□□ -1.21
LETMD1-238	ENST00000623495	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		7.46	□□□□□ -1.21
LETMD1-238	ENST00000623495	DRC3	Q9H069	523 aa		7.46	□□□□□ -1.21
LETMD1-238	ENST00000623495	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	7.46	□□□□□ -1.21
LETMD1-238	ENST00000623495	PLK2	Q9NYY3	685 aa		7.46	□□□□□ -1.21
LETMD1-238	ENST00000623495	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		7.46	□□□□□ -1.21
LETMD1-238	ENST00000623495	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.21
LETMD1-238	ENST00000623495	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		7.46	□□□□□ -1.21
LETMD1-238	ENST00000623495	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		7.46	□□□□□ -1.21
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.21
LETMD1-238	ENST00000623495	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.21
LETMD1-238	ENST00000623495	ARID2	Q68CP9	1835 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495		M0QZQ0	153 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	XYLB	O75191	536 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ATF6	P18850	670 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	NFKBIA	P25963	317 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	GJC1	P36383	396 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	AVPR1A	P37288	418 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	PGF	P49763	221 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	AP3M2	P53677	418 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	TUBA4A	P68366	448 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	PTK2	Q05397	1052 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ADIG	Q0VDE8	80 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	GPR17	Q13304	367 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ITGA9	Q13797	1035 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	GPR158	Q5T848	1215 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CCNJL	Q8IV13	435 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	KNL1	Q8NG31	2342 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	LTBP2	Q14767	1821 aa		7.46	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	C2orf78	A6NCI8	922 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRC53	A6NM62	1247 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	LGALS16	A8MUM7	142 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CAPN9	O14815	690 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP5H	O75947	161 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	OAZ2	O95190	189 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	PAFAH1B1	P43034	410 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	PDE6C	P51160	858 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC5A3	P53794	718 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	FOXK1	P85037	733 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ADAM15	Q13444	863 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	TAF5	Q15542	800 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	PIGZ	Q86VD9	579 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	SPATA24	Q86W54	205 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	EFHB	Q8N7U6	833 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	NAT14	Q8WUY8	206 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	FGF13	Q92913	245 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	GCNA	Q96QF7	691 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC22A12	Q96S37	553 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ACBD6	Q9BR61	282 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	GKN1	Q9NS71	199 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF14	Q9UBS8	474 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	DMD	P11532	3685 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	OR6C75	A6NL08	312 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	MATN2	O00339	956 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CILP	O75339	1184 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	GSTT2	P0CG29	244 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	GSTT2B	P0CG30	244 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	VAV1	P15498	845 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CEBPB	P17676	345 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	FSHR	P23945	695 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ATIC	P31939	592 aa		7.45	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CCNF	P41002	786 aa		7.45	□□□□□ -1.22

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