RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622972.3

LINC00963-215, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00963, Length 444 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-215ENST00000622972 USP8P40818 1118 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 PRKCIP41743 596 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 TNFRSF4P43489 277 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 PLA2G4AP47712 749 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 KIF11P52732 1056 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 EPHA4P54764 986 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 SLC8A3P57103 927 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 NOMO3P69849 1222 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 ADIGQ0VDE8 80 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 PDCLQ13371 301 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 CNGA2Q16280 664 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 C4orf17Q53FE4 359 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 SGO2Q562F6 1265 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 TBCELQ5QJ74 424 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 C10orf120Q5SQS8 335 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 GRAMD4Q6IC98 578 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 LPCAT2Q7L5N7 544 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 C12orf40Q86WS4 652 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 TMEM139Q8IV31 216 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 SFTPA1Q8IWL2 248 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 TMEFF1Q8IYR6 380 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 IL17RCQ8NAC3 791 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 NEK11Q8NG66 645 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 SLC30A5Q8TAD4 765 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 RLN3Q8WXF3 142 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 BHMTQ93088 406 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 CHP1Q99653 195 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 BBS2Q9BXC9 721 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 ULBP1Q9BZM6 244 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 SPHK2Q9NRA0 654 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 RXFP3Q9NSD7 469 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 COMMD8Q9NX08 183 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 EBF1Q9UH73 591 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 RASAL2Q9UJF2 1139 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 NAGPAQ9UK23 515 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 CAPN11Q9UMQ6 739 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 GPR179Q6PRD1 2367 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 A0A0U1RQJ8 604 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 A0A1W2PQH9 124 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 A0A1W2PQJ5 194 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 E5RJQ4 531 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 I6L893 689 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 GREM1O60565 184 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 TBX18O95935 607 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 CFIP05156 583 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 HMBSP08397 361 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 RALAP11233 206 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 UNGP13051 313 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 RARGP13631 454 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 HOXB2P14652 356 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 TYRP14679 529 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 BCKDHBP21953 392 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 NTSR1P30989 418 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 MAPK8P45983 427 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 TUBP50607 506 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 LIMK1P53667 647 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 BCAT1P54687 386 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 ADKP55263 362 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 CDR2Q01850 454 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 PTSQ03393 145 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 ARID5AQ03989 594 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 MESP2Q0VG99 397 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 BST2Q10589 180 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 CETN1Q12798 172 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 GAB4Q2WGN9 574 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 PMS2CLQ68D20 193 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 PM20D1Q6GTS8 502 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 TMC6Q7Z403 805 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 TADA2BQ86TJ2 420 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 TMEM25Q86YD3 366 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00963-215ENST00000622972 MIB1Q86YT6 1006 aa6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms