RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 GUCY1A3Q02108 690 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 IRF7Q92985 503 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 TJP2Q9UDY2 1190 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 ITGAVP06756 1048 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 SETSIPP0DME0 302 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 YWHAQP27348 245 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 HPDP32754 393 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 PCK1P35558 622 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 VCPP55072 806 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
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SGMS1-210ENST00000619438 SLC44A4Q53GD3 710 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 FOXR1Q6PIV2 292 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 ALLCQ8N6M5 410 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 SHDQ96IW2 340 aa22.26■■□□□ 1.15
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SGMS1-210ENST00000619438 ARHGEF3Q9NR81 526 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
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SGMS1-210ENST00000619438 DNPEPQ9ULA0 475 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 KMT2EQ8IZD2 1858 aa22.25■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 LRRD1A4D1F6 860 aa22.25■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 KRBA1A5PL33 1030 aa22.25■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 SOBPA7XYQ1 873 aa22.25■■□□□ 1.15
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SGMS1-210ENST00000619438 TAF10Q12962 218 aa22.25■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa22.25■■□□□ 1.15
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SGMS1-210ENST00000619438 TTC16Q8NEE8 873 aa22.25■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 SLC35B2Q8TB61 432 aa22.25■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 CENPTQ96BT3 561 aa22.25■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 CYP2S1Q96SQ9 504 aa22.25■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 TDP1Q9NUW8 608 aa22.25■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa22.24■■□□□ 1.15
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SGMS1-210ENST00000619438 TTC4O95801 387 aa22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 CKMP06732 381 aa22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 WEE1P30291 646 aa22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 CHKAP35790 457 aa22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 KAZNQ674X7 775 aa22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 BBS12Q6ZW61 710 aa22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 SMOQ99835 787 aa22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 TTLL2Q9BWV7 592 aa22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 ASNSD1Q9NWL6 643 aa22.24■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
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SGMS1-210ENST00000619438 PRAMEF12O95522 483 aa22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 HDCP19113 662 aa22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 IL1R2P27930 398 aa22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
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SGMS1-210ENST00000619438 IZUMO3Q5VZ72 239 aa22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 GSTA5Q7RTV2 222 aa22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC25Q86WR0 208 aa22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 BPIFB1Q8TDL5 484 aa22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 FBXO32Q969P5 355 aa22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 RSPRY1Q96DX4 576 aa22.23■■□□□ 1.15
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SGMS1-210ENST00000619438 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF148Q9UQR1 794 aa22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 RASGRF2O14827 1237 aa22.23■■□□□ 1.15
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SGMS1-210ENST00000619438 USP17L7P0C7H9 530 aa22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 KDELR1P24390 212 aa22.23■■□□□ 1.15
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SGMS1-210ENST00000619438 SLC5A3P53794 718 aa22.23■■□□□ 1.15
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SGMS1-210ENST00000619438 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 STK32AQ8WU08 396 aa22.23■■□□□ 1.15
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SGMS1-210ENST00000619438 C2orf78A6NCI8 922 aa22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 MMP13P45452 471 aa22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 CLCN5P51795 746 aa22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 SLC8A3P57103 927 aa22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 ZMIZ2Q8NF64 920 aa22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 UBA3Q8TBC4 463 aa22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 FAM118BQ9BPY3 351 aa22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 TBC1D17Q9HA65 648 aa22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 PCDH9Q9HC56 1237 aa22.22■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 HEBP1Q9NRV9 189 aa22.22■■□□□ 1.15
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