RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 SMC2O95347 1197 aa12.22□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 CLDN1O95832 211 aa12.22□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa12.22□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 LIPCP11150 499 aa12.22□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 ANXA13P27216 316 aa12.22□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP12.22□□□□□ -0.451e-6■■■□□ 14.6
HCG18-241ENST00000602290 GALCP54803 685 aa12.22□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 POLE2P56282 527 aa12.22□□□□□ -0.45
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HCG18-241ENST00000602290 IQCB1Q15051 598 aa12.22□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 HECTD3Q5T447 861 aa12.22□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 FHL5Q5TD97 284 aa12.22□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 FYB2Q5VWT5 728 aa12.22□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 SLC39A4Q6P5W5 647 aa12.22□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 NCEH1Q6PIU2 408 aa12.22□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa12.22□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 Q6ZNB5 142 aa12.22□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa12.22□□□□□ -0.45
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HCG18-241ENST00000602290 PDZD8Q8NEN9 1154 aa12.22□□□□□ -0.45
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HCG18-241ENST00000602290 MAPK15Q8TD08 544 aa12.22□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 FAM212AQ96EL1 285 aa12.22□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 FAM210AQ96ND0 272 aa12.22□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 SYT15Q9BQS2 421 aa12.22□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 ELOVL2Q9NXB9 296 aa12.22□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 GDAP2Q9NXN4 497 aa12.22□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 SERGEFQ9UGK8 458 aa12.22□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa12.22□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 SMC3Q9UQE7 1217 aa12.22□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa12.22□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 HUS1O60921 280 aa12.21□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 PDCP20941 246 aa12.21□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 SLC5A2P31639 672 aa12.21□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 LHX1P48742 406 aa12.21□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 CCR5P51681 352 aa12.21□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 SCARA3Q6AZY7 606 aa12.21□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 C1orf186Q6ZWK4 172 aa12.21□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 USP30Q70CQ3 517 aa12.21□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 TMC6Q7Z403 805 aa12.21□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 LIMS2Q7Z4I7 341 aa12.21□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 C14orf80Q86SX3 495 aa12.21□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 VASH2Q86V25 355 aa12.21□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 TOP6BLQ8N6T0 577 aa12.21□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 ERMNQ8TAM6 284 aa12.21□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa12.21□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 BHMTQ93088 406 aa12.21□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 PCED1BQ96HM7 432 aa12.21□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa12.21□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 APOLD1Q96LR9 279 aa12.21□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 USP29Q9HBJ7 922 aa12.21□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP12.21□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 UCKL1Q9NWZ5 548 aa12.21□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP12.21□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 MTMR6Q9Y217 621 aa12.21□□□□□ -0.45
HCG18-241ENST00000602290 ANKRD33BA6NCL7 494 aa12.2□□□□□ -0.46
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HCG18-241ENST00000602290 SFI1A8K8P3 1242 aa12.2□□□□□ -0.46
HCG18-241ENST00000602290 ERLIN1O75477 346 aa12.2□□□□□ -0.46
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HCG18-241ENST00000602290 CCDC168Q8NDH2 2452 aa12.2□□□□□ -0.46
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HCG18-241ENST00000602290 LMO2P25791 158 aa12.19□□□□□ -0.46
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HCG18-241ENST00000602290 STX1AQ16623 288 aa12.19□□□□□ -0.46
HCG18-241ENST00000602290 TUBB8Q3ZCM7 444 aa12.19□□□□□ -0.46
HCG18-241ENST00000602290 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
HCG18-241ENST00000602290 RINT1Q6NUQ1 792 aa12.19□□□□□ -0.46
HCG18-241ENST00000602290 BORAQ6PGQ7 559 aa12.19□□□□□ -0.46
HCG18-241ENST00000602290 FOXR1Q6PIV2 292 aa12.19□□□□□ -0.46
HCG18-241ENST00000602290 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
HCG18-241ENST00000602290 IQCHQ86VS3 1027 aa12.19□□□□□ -0.46
HCG18-241ENST00000602290 LRRC52Q8N7C0 313 aa12.19□□□□□ -0.46
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