RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600393.1

FCHO1-233, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 4

Gene FCHO1, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-233	ENST00000600393	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	APC2	O95996	2303 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	PLXNA2	O75051	1894 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	SIN3B	O75182	1162 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	FSBP	O95073	299 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	SEMA4F	O95754	770 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC9A1	P19634	815 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	GNA15	P30679	374 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	GGCX	P38435	758 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	USP8	P40818	1118 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	PDCL	Q13371	301 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	CHSY1	Q86X52	802 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	SERPINB11	Q96P15	392 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	COX16	Q9P0S2	106 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		13.36	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	TTC34	A8MYJ7	566 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	KCNK3	O14649	394 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	IRAK2	O43187	625 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	GRAP2	O75791	330 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	GNA14	O95837	355 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	DNTT	P04053	509 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	IRAK1	P51617	712 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	CENPC	Q03188	943 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	HLA-B	Q31612	363 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	MPP7	Q5T2T1	576 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	APCDD1	Q8J025	514 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	BIRC7	Q96CA5	298 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	CPXM1	Q96SM3	734 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	ATRX	P46100	2492 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393		H0Y626	953 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	CAPN9	O14815	690 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	MID1	O15344	667 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	CBFA2T3	O75081	653 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	TRIM16	O95361	564 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	IGLV3-25	P01717	112 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	APOE	P02649	317 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	VAV1	P15498	845 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	TACR2	P21452	398 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	MATK	P42679	507 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	METAP1	P53582	386 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	IL9R	Q01113	521 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	NNT	Q13423	1086 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	KIF19	Q2TAC6	998 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	GANC	Q8TET4	914 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	AZIN2	Q96A70	460 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	TTC17	Q96AE7	1141 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	SIX2	Q9NPC8	291 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	ACACA	Q13085	2346 aa		13.34	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393		A0A1W2PP55	124 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-233	ENST00000600393	PLK4	O00444	970 aa		13.33	□□□□□ -0.28

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms