RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599909.1

RPS5-208, Transcript of ribosomal protein S5, human

TSL 2

Gene RPS5, Length 523 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS5-208	ENST00000599909	TBX4	P57082	545 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	FSCB	Q5H9T9	825 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	DHRS13	Q6UX07	377 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	USP30	Q70CQ3	517 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	GANC	Q8TET4	914 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	TTC17	Q96AE7	1141 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	CRELD1	Q96HD1	420 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	TSG101	Q99816	390 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909		A0A1B0GTQ1	180 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909		A0A1W2PPC4	97 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	TTC34	A8MYJ7	566 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	CBX4	O00257	560 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	WNT9A	O14904	365 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	VILL	O15195	856 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	FMO5	P49326	533 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	CLDN6	P56747	220 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	C21orf59	P57076	290 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	ST8SIA6	P61647	398 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	CST6	Q15828	149 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	CNGA2	Q16280	664 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	AZIN2	Q96A70	460 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	MIS12	Q9H081	205 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	RMND1	Q9NWS8	449 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	C10orf142	B7Z368	130 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	ASL	P04424	464 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	PSMD8	P48556	350 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	CDH18	Q13634	790 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	KCNJ12	Q14500	433 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	SHB	Q15464	509 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	ADAM32	Q8TC27	787 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	SLC39A13	Q96H72	371 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	HSFY1	Q96LI6	401 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	NT5C1B	Q96P26	610 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	SCML1	Q9UN30	329 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909		A0A1W2PR77	199 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	PLK4	O00444	970 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	FBXO21	O94952	628 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	NUMB	P49757	651 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	LRRC63	Q05C16	580 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	DNAJC3	Q13217	504 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	ARID5B	Q14865	1188 aa		11.6	□□□□□ -0.55
RPS5-208	ENST00000599909	INAVA	Q3KP66	663 aa		11.6	□□□□□ -0.55

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