RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 STAP1Q9ULZ2 295 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 MATKP42679 507 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 MAPK8P45983 427 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 HADHBP55084 474 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 SCAPQ12770 1279 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM68Q6AZZ1 485 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 MSANTD2Q6P1R3 559 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 TSTD1Q8NFU3 115 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF139Q8WU17 664 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGEF26Q96DR7 871 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 NUP85Q9BW27 656 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 NMUR1Q9HB89 426 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM170AA1A519 330 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT86O43790 486 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 TLR5O60602 858 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 RARGP13631 454 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP4F8P98187 520 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 MCEEQ96PE7 176 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 NCAPGQ9BPX3 1015 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM191CA6NGB0 347 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 C2CD4BA6NLJ0 364 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 OAS1P00973 400 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 NCAM1P13591 858 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 ENGP17813 658 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 GPD1P21695 349 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 BCKDHBP21953 392 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 PTPN9P43378 593 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 TAF5Q15542 800 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF423Q2M1K9 1284 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 CMTM8Q8IZV2 173 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 DEFB106AQ8N104 65 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 TPSD1Q9BZJ3 242 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 GON4LQ3T8J9 2241 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 OLFM2O95897 454 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 ABL1P00519 1130 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 FYNP06241 537 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 SDC4P31431 198 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 NNTQ13423 1086 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 DCAF6Q58WW2 860 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 RASSF3Q86WH2 238 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC35G2Q8TBE7 412 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 CNPY3Q9BT09 278 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 OSER1Q9NX31 292 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 PI4KAP42356 2102 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 BPTFQ12830 3046 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 APC2O95996 2303 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 OBSL1O75147 1896 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 ASXL3Q9C0F0 2248 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 RCCD1A6NED2 376 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 GRAP2O75791 330 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 ARSAP15289 507 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 PDGFRAP16234 1089 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 GJA4P35212 333 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 FLT3P36888 993 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGAP25P42331 645 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC25A52Q3SY17 297 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 SYT12Q8IV01 421 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC26Q8TAB7 109 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 JOSD2Q8TAC2 188 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 RXFP2Q8WXD0 754 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 EDEM1Q92611 657 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 NT5C3BQ969T7 300 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 SERPINB11Q96P15 392 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 LACRTQ9GZZ8 138 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 IP6K2Q9UHH9 426 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 DNMT3LQ9UJW3 386 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 ANAPC7Q9UJX3 599 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 CCL26Q9Y258 94 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 MYO1FO00160 1098 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 F9P00740 461 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 AVPR1AP37288 418 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 PDGFRLQ15198 375 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 C10orf120Q5SQS8 335 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC23A3Q6PIS1 610 aa24.48■■□□□ 1.51
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