RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa26.62■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 M0QYV0 167 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 BRD2P25440 801 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS24P62847 133 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 COBLL1Q53SF7 1204 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 KAT5Q92993 513 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 AZIN2Q96A70 460 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 EBF2Q9HAK2 575 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 SCUBE2Q9NQ36 999 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 RMND1Q9NWS8 449 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 SCML1Q9UN30 329 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa26.61■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PP55 124 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PPC4 97 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 VILLO15195 856 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 MID1O15344 667 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 FYNP06241 537 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 GALCP54803 685 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 ST8SIA6P61647 398 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 RACK1P63244 317 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 CNGA2Q16280 664 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 FSCBQ5H9T9 825 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 NCEH1Q6PIU2 408 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 DHRS13Q6UX07 377 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 CARNMT1Q8N4J0 409 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 MIS12Q9H081 205 aa26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GTQ1 180 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 ASLP04424 464 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 WNT1P04628 370 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 FMO5P49326 533 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 C21orf59P57076 290 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 CST6Q15828 149 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 C9orf64Q5T6V5 341 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 GATAD2AQ86YP4 633 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 LRIG1Q96JA1 1093 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 NEUROG2Q9H2A3 272 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 FTSJ1Q9UET6 329 aa26.59■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 LOC400499M0QZD8 3231 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 CDH18Q13634 790 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 INAVAQ3KP66 663 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 PITRM1Q5JRX3 1037 aa26.58■■□□□ 1.85
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CAPNS1-211ENST00000590874 CFAP52Q8N1V2 620 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 ENGASEQ8NFI3 743 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
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CAPNS1-211ENST00000590874 HSFY1Q96LI6 401 aa26.58■■□□□ 1.85
CAPNS1-211ENST00000590874 NT5C1BQ96P26 610 aa26.58■■□□□ 1.85
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CAPNS1-211ENST00000590874 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC34A8MYJ7 566 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 C10orf142B7Z368 130 aa26.57■■□□□ 1.84
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CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC63Q05C16 580 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 ARID5BQ14865 1188 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 MS4A13Q5J8X5 152 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 PPM1KQ8N3J5 372 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAM32Q8TC27 787 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC39A13Q96H72 371 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 GSDMAQ96QA5 445 aa26.57■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
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CAPNS1-211ENST00000590874 TLR6Q9Y2C9 796 aa26.57■■□□□ 1.84
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CAPNS1-211ENST00000590874 PLXNA2O75051 1894 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 CBX4O00257 560 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 WNT9AO14904 365 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 DFNA5O60443 496 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO21O94952 628 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNJ12Q14500 433 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 SHBQ15464 509 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 DCAF6Q58WW2 860 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 KDM1BQ8NB78 822 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINB11Q96P15 392 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa26.56■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC8A1P32418 973 aa26.55■■□□□ 1.84
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