RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 IL4RP24394 825 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 NHLH1Q02575 133 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 CREMQ03060 361 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 TAF5Q15542 800 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM171A1Q5VUB5 890 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 CD300LGQ6UXG3 332 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 C10orf67Q8IYJ2 551 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 KCTD13Q8WZ19 329 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 GRAMD1AQ96CP6 724 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 MAGEB18Q96M61 343 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 CLSTN3Q9BQT9 956 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 TTPALQ9BTX7 342 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM49BQ9NUQ9 324 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM47DPA6NHR8 397 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 PAX3P23760 479 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 GCAP28676 217 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC38Q502W7 563 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 GLRA4Q5JXX5 417 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC34Q8IZ02 419 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 DHRS4Q9BTZ2 278 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 ACSS3Q9H6R3 686 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 VPS37BQ9H9H4 285 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 MYO10Q9HD67 2058 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 RASA4BC9J798 803 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 RASA4O43374 803 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 GABBR2O75899 941 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 GSTA2P09210 222 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 HDAC4P56524 1084 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 IFT88Q13099 833 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 ADGRF2Q8IZF7 708 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 PQLC3Q8N755 202 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM71DQ8N9W8 422 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 USP29Q9HBJ7 922 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 C2orf16Q68DN1 1984 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC20A2Q08357 652 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNJ11Q14654 390 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 RGS9BPQ6ZS82 235 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 CYP4X1Q8N118 509 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM86AQ8N2M4 240 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 PRSS33Q8NF86 280 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC39Q96DD0 335 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNK9Q9NPC2 374 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 H7C0C1 242 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM66O15016 1216 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 DAB1O75553 588 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP5OP48047 213 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 CLCNKBP51801 687 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 LILRA4P59901 499 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 IL9RQ01113 521 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 MMRN1Q13201 1228 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 UPP1Q16831 310 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 CEP57Q86XR8 500 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 SCUBE3Q8IX30 993 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 MCUQ8NE86 351 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 DUSP16Q9BY84 665 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 PNPLA8Q9NP80 782 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 RABGEF1Q9UJ41 708 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 CLUHO75153 1309 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 HACD1B0YJ81 288 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 GABRDO14764 452 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 SPTLC1O15269 473 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 GSTA1P08263 222 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 VIMP08670 466 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 FGFR3P22607 806 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 AVPR2P30518 371 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 GPX6P59796 221 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP11AP98196 1134 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 TMED2Q15363 201 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD22Q5VYY1 191 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 SCYL2Q6P3W7 929 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 ADGRD1Q6QNK2 874 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 PCDH19Q8TAB3 1148 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 PRKD2Q9BZL6 878 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 DPEP3Q9H4B8 488 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 B3GAT3O94766 335 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 OAS1P00973 400 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 STX2P32856 288 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 MATKP42679 507 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms